<div dir="rtl"><div style="text-align:left" dir="ltr"><span style="font-size:12.8px">Thank you very much for the quick answer !</span></div><div style="text-align:left" dir="ltr"><span style="font-size:12.8px"><br></span></div><div style="text-align:left" dir="ltr"><span style="font-size:12.8px">Sorry for posting in different emails, but I have 2 more questions:</span></div><div style="text-align:left" dir="ltr"><span style="font-size:12.8px"><br></span></div><div style="text-align:left" dir="ltr"><span style="font-size:12.8px">* Is there a way to extract Axial diffusivity also ?</span></div><div style="text-align:left" dir="ltr"><span style="font-size:12.8px">* What does 'relative anisotrophy' stands for ?</span></div><span style="font-size:12.8px"><div style="text-align:left"><br></div></span><div class="gmail_extra"><div dir="ltr"><span style="font-size:12.8px">Many thanks !</span><br clear="all"></div><div dir="ltr"><span style="font-size:12.8px"><br></span></div><div><div class="gmail_signature" data-smartmail="gmail_signature"><div dir="rtl"><div style="text-align:left"><font color="#888888">Rotem Saar-Ashkenazy</font></div><font color="#888888"><div style="text-align:left"><br>Department of Brain and Cognitive Science<br>Ben Gurion University of the Negev, Beer-Sheva, 84105</div><div style="text-align:left"><br></div></font><div style="text-align:left" dir="ltr"><font color="#888888">School of Social Work</font></div><div style="text-align:left" dir="ltr"><font color="#888888">Ashkelon Academic College, Ashkelon, 78211<font color="#222222"> </font></font></div><div style="text-align:left" dir="ltr"><br></div><font color="#888888"><p style="margin:0cm 0cm 0pt;text-align:left;direction:ltr"><font color="#888888">Israel</font></p></font></div></div></div>
<br><div class="gmail_quote"><div dir="ltr">2016-06-17 19:00 GMT+03:00  <span dir="ltr"><<a href="mailto:mristudio-users-request@mristudio.org" target="_blank">mristudio-users-request@mristudio.org</a>></span>:</div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left-width:1px;border-left-style:solid;border-left-color:rgb(204,204,204);padding-left:1ex">Send mristudio-users mailing list submissions to<br>
        <a href="mailto:mristudio-users@mristudio.org">mristudio-users@mristudio.org</a><br>
<br>
To subscribe or unsubscribe via the World Wide Web, visit<br>
        <a href="http://lists.mristudio.org/mailman/listinfo/mristudio-users" rel="noreferrer" target="_blank">http://lists.mristudio.org/mailman/listinfo/mristudio-users</a><br>
or, via email, send a message with subject or body 'help' to<br>
        <a href="mailto:mristudio-users-request@mristudio.org">mristudio-users-request@mristudio.org</a><br>
<br>
You can reach the person managing the list at<br>
        <a href="mailto:mristudio-users-owner@mristudio.org">mristudio-users-owner@mristudio.org</a><br>
<br>
When replying, please edit your Subject line so it is more specific<br>
than "Re: Contents of mristudio-users digest..."<br>
<br>
<br>
Today's Topics:<br>
<br>
   1. Mean diffusivisy values in DTIstudio (Rotem Saar)<br>
   2. Re: Mean diffusivisy values in DTIstudio (Susumu Mori)<br>
<br>
<br>
----------------------------------------------------------------------<br>
<br>
Message: 1<br>
Date: Thu, 16 Jun 2016 10:22:57 +0300<br>
From: Rotem Saar <<a href="mailto:saar.rotem@gmail.com">saar.rotem@gmail.com</a>><br>
To: <a href="mailto:mristudio-users@mristudio.org">mristudio-users@mristudio.org</a>,<br>
        <a href="mailto:mristudio-users-request@mristudio.org">mristudio-users-request@mristudio.org</a><br>
Subject: [Mristudio-users] Mean diffusivisy values in DTIstudio<br>
Message-ID:<br>
        <<a href="mailto:CAMjFEmYp3SemsJ6GzkwJ18QL737oCiWvyM5Fb2eTFnjboLCscg@mail.gmail.com">CAMjFEmYp3SemsJ6GzkwJ18QL737oCiWvyM5Fb2eTFnjboLCscg@mail.gmail.com</a>><br>
Content-Type: text/plain; charset="utf-8"<br>
<br>
Hi all,<br>
<br>
I was wondering if there is any possible way to extract mean diffusivity<br>
maps (MD) in DTIstudio ? If yes, which map should I save following the<br>
automatic image registration and tensor calculation ?<br>
<br>
I have FA and RD values for the Corpus-callosum and I would like to extract<br>
also MD values for this fiber.<br>
<br>
Thanks<br>
<br>
<br>
Rotem Saar-Ashkenazy<br>
<br>
Department of Brain and Cognitive Science<br>
Ben Gurion University of the Negev, Beer-Sheva, 84105<br>
<br>
School of Social Work<br>
Ashkelon Academic College, Ashkelon, 78211<br>
<br>
Israel<br>
-------------- next part --------------<br>
An HTML attachment was scrubbed...<br>
URL: <<a href="http://lists.mristudio.org/pipermail/mristudio-users/attachments/20160616/abf8b65b/attachment-0002.html" rel="noreferrer" target="_blank">http://lists.mristudio.org/pipermail/mristudio-users/attachments/20160616/abf8b65b/attachment-0002.html</a>><br>
<br>
------------------------------<br>
<br>
Message: 2<br>
Date: Thu, 16 Jun 2016 16:42:26 -0400<br>
From: Susumu Mori <<a href="mailto:smoriw@gmail.com">smoriw@gmail.com</a>><br>
To: "DTI Studio, ROI Editor,    DiffeoMap Questions/Support"<br>
        <<a href="mailto:mristudio-users@mristudio.org">mristudio-users@mristudio.org</a>><br>
Cc: <a href="mailto:mristudio-users-request@mristudio.org">mristudio-users-request@mristudio.org</a><br>
Subject: Re: [Mristudio-users] Mean diffusivisy values in DTIstudio<br>
Message-ID:<br>
        <<a href="mailto:CAEq9apJs0PUYL4SGx-JyDD1QTNpXRN3pr4R%2BtSt%2B8dF8jm3fxQ@mail.gmail.com">CAEq9apJs0PUYL4SGx-JyDD1QTNpXRN3pr4R+tSt+8dF8jm3fxQ@mail.gmail.com</a>><br>
Content-Type: text/plain; charset="utf-8"<br>
<br>
Mean diffusivity is Trace/3, while the Trace = (lambda1 + lambda2 +<br>
lambda3).<br>
<br>
You can find "Trace" in DtiStudio.<br>
So you should report this value as "Trace" or divide it by 3 and report it<br>
as "mean diffusivity".<br>
<br>
By the way, MD is called "Mean" because it is the mean of lambda 1-3.<br>
<br>
On Thu, Jun 16, 2016 at 3:22 AM, Rotem Saar <<a href="mailto:saar.rotem@gmail.com">saar.rotem@gmail.com</a>> wrote:<br>
<br>
> Hi all,<br>
><br>
> I was wondering if there is any possible way to extract mean diffusivity<br>
> maps (MD) in DTIstudio ? If yes, which map should I save following the<br>
> automatic image registration and tensor calculation ?<br>
><br>
> I have FA and RD values for the Corpus-callosum and I would like to<br>
> extract also MD values for this fiber.<br>
><br>
> Thanks<br>
><br>
><br>
> Rotem Saar-Ashkenazy<br>
><br>
> Department of Brain and Cognitive Science<br>
> Ben Gurion University of the Negev, Beer-Sheva, 84105<br>
><br>
> School of Social Work<br>
> Ashkelon Academic College, Ashkelon, 78211<br>
><br>
> Israel<br>
><br>
> _______________________________________________<br>
> mristudio-users mailing list<br>
> <a href="mailto:mristudio-users@mristudio.org">mristudio-users@mristudio.org</a><br>
> <a href="http://lists.mristudio.org/mailman/listinfo/" rel="noreferrer" target="_blank">http://lists.mristudio.org/mailman/listinfo/</a><br>
> Unsubscribe, send a blank email to:<br>
> <a href="mailto:mristudio-users-unsubscribe@mristudio.org">mristudio-users-unsubscribe@mristudio.org</a><br>
><br>
><br>
-------------- next part --------------<br>
An HTML attachment was scrubbed...<br>
URL: <<a href="http://lists.mristudio.org/pipermail/mristudio-users/attachments/20160616/06e6e715/attachment-0001.html" rel="noreferrer" target="_blank">http://lists.mristudio.org/pipermail/mristudio-users/attachments/20160616/06e6e715/attachment-0001.html</a>><br>
<br>
------------------------------<br>
<br>
Subject: Digest Footer<br>
<br>
_______________________________________________<br>
mristudio-users mailing list<br>
<a href="mailto:mristudio-users@mristudio.org">mristudio-users@mristudio.org</a><br>
<a href="http://lists.mristudio.org/mailman/listinfo/mristudio-users" rel="noreferrer" target="_blank">http://lists.mristudio.org/mailman/listinfo/mristudio-users</a><br>
<br>
<br>
------------------------------<br>
<br>
End of mristudio-users Digest, Vol 185, Issue 1<br>
***********************************************<br>
</blockquote></div><br></div></div>