<div dir="ltr"><div>You need to warp our atlas image to your subject data using DiffeoMap and apply the transformation to the atlases ROI file, such that the the subject brain is automatically segmented into various regions.</div><div><br></div><div>Then you need to pick regions of interest using RoiEditor and feed it into DtiStudio for fiber tracking.</div><div><br></div><div>I know that this is quite a process to master.</div><div><br></div>I would recommend to consult with Dr. Zhang about how to streamline the process.</div><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote">On Tue, Nov 10, 2015 at 6:18 PM, Shaimaa Abdelsattar <span dir="ltr"><<a href="mailto:shaimaa96@hotmail.com" target="_blank">shaimaa96@hotmail.com</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div><div><div style="font-family:Calibri,sans-serif;font-size:11pt">Dear experts,<br>I'd like to ask how I can extract a roi of certain structure  in the template and back project it in subject's native space for more accurate measurements using DTI studio, Roi editor or  DiffeoMap.<br><br>Thank you in advance<br>Shaimaa Mohammad, MD<br><br>Sent from my Windows Phone</div></div></div><br>_______________________________________________<br>
mristudio-users mailing list<br>
<a href="mailto:mristudio-users@mristudio.org">mristudio-users@mristudio.org</a><br>
<a href="http://lists.mristudio.org/mailman/listinfo/" rel="noreferrer" target="_blank">http://lists.mristudio.org/mailman/listinfo/</a><br>
Unsubscribe, send a blank email to: <a href="mailto:mristudio-users-unsubscribe@mristudio.org">mristudio-users-unsubscribe@mristudio.org</a><br>
<br></blockquote></div><br></div>