<html>
<head>
<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=iso-8859-1">
<style type="text/css" style="display:none"><!-- P {MARGIN-TOP: 0px; MARGIN-BOTTOM: 0px;}--></style>
</head>
<body dir="ltr" style="font-size:12pt;color:#000000;background-color:#FFFFFF;font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif;">
<span style="BACKGROUND-COLOR: white; FONT-SIZE: 12pt" dir="ltr"><font face="Calibri"> </font>
<div style="MARGIN-TOP: 0px; MARGIN-BOTTOM: 0px">You need to modify the map file in order to load the binary maps into DtiStudio. Please take a look at this explanation at
<a href="https://www.mristudio.org/wiki/faq#head-f80df539228dfb62e6fa6c79bef04491eb2f8db6" target="_blank" jQuery1720056351187798190705="832">
https://www.mristudio.org/wiki/faq#head-f80df539228dfb62e6fa6c79bef04491eb2f8db6</a> </div>
<div style="MARGIN-TOP: 0px; MARGIN-BOTTOM: 0px"> </div>
<div style="MARGIN-TOP: 0px; MARGIN-BOTTOM: 0px"> </div>
<div style="MARGIN-TOP: 0px; MARGIN-BOTTOM: 0px">Xin</div>
</span>
<div style="COLOR: #212121">
<hr style="WIDTH: 98%; DISPLAY: inline-block" tabindex="-1">
<div dir="ltr" id="divRplyFwdMsg"><font style="FONT-SIZE: 11pt" color="#000000" face="Calibri, sans-serif"><b>From:</b> Radhika Teli <radhikateli24@gmail.com><br>
<b>Sent:</b> Monday, June 8, 2015 2:32 PM<br>
<b>To:</b> DTI Studio, ROI Editor, DiffeoMap Questions/Support; Xin Li<br>
<b>Subject:</b> Re: [Mristudio-users] Importing ROI into Fiber Tracking Function of DTI Studio</font>
<div> </div>
</div>
<div>
<div dir="ltr">
<div>When I choose the Binary Map option, it saves as multiple .dat files. DTIStudio ROI function of Fiber Tracking does not recognize these files.</div>
<div> </div>
<div>Thank you,</div>
<div>Radhika</div>
</div>
<div class="gmail_extra"><br>
<div class="gmail_quote">On Mon, Jun 8, 2015 at 2:25 PM, Xin Li <span dir="ltr"><<a href="mailto:xli16@jhmi.edu" target="_blank">xli16@jhmi.edu</a>></span> wrote:<br>
<blockquote style="BORDER-LEFT: #ccc 1px solid; MARGIN: 0px 0px 0px 0.8ex; PADDING-LEFT: 1ex" class="gmail_quote">
<div style="BACKGROUND-COLOR: rgb(255,255,255); FONT-FAMILY: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; COLOR: rgb(0,0,0); FONT-SIZE: 12pt" dir="ltr">
<p>If you have loaded the map as ROI in ROIEditor, you can use the function "Save ROI" to save your map as binary maps. Please take a look at this manual at
<a href="https://www.mristudio.org/wiki/user_manual/roieditor/ROIDraw_Load_Save" target="_blank">
https://www.mristudio.org/wiki/user_manual/roieditor/ROIDraw_Load_Save</a> .</p>
<p> </p>
<p> </p>
<p>Xin</p>
<div style="COLOR: rgb(33,33,33)">
<hr style="WIDTH: 98%; DISPLAY: inline-block">
<div dir="ltr"><font style="FONT-SIZE: 11pt" color="#000000" face="Calibri, sans-serif"><span><b>From:</b> mristudio-users <<a href="mailto:mristudio-users-bounces@mristudio.org" target="_blank">mristudio-users-bounces@mristudio.org</a>> on behalf of Radhika
 Teli <<a href="mailto:radhikateli24@gmail.com" target="_blank">radhikateli24@gmail.com</a>><br>
</span><b>Sent:</b> Monday, June 8, 2015 1:42 PM<br>
<b>To:</b> DTI Studio, ROI Editor, DiffeoMap Questions/Support<br>
<b>Subject:</b> Re: [Mristudio-users] Importing ROI into Fiber Tracking Function of DTI Studio</font>
<div> </div>
</div>
<div>
<div class="h5">
<div>
<div dir="ltr">
<div>Hello,</div>
<div> </div>
<div>I have imported my segmented object map into ROI editor (Analyze .img format converted to raw (.dat) format. How can I convert this to binary map in ROI editor so I can load the binary map image in DTI Studio?</div>
<div> </div>
<div>Thanks,</div>
</div>
<div class="gmail_extra"><br>
<div class="gmail_quote">On Wed, Apr 29, 2015 at 10:19 AM, Xin Li <span dir="ltr">
<<a href="mailto:xli16@jhmi.edu" target="_blank">xli16@jhmi.edu</a>></span> wrote:<br>
<blockquote style="BORDER-LEFT: rgb(204,204,204) 1px solid; MARGIN: 0px 0px 0px 0.8ex; PADDING-LEFT: 1ex" class="gmail_quote">
<div style="BACKGROUND-COLOR: rgb(255,255,255); FONT-FAMILY: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; COLOR: rgb(0,0,0); FONT-SIZE: 12pt" dir="ltr">
<p>Please take a look at this explanation at <a href="https://www.mristudio.org/wiki/faq#head-f80df539228dfb62e6fa6c79bef04491eb2f8db6" target="_blank">
https://www.mristudio.org/wiki/faq#head-f80df539228dfb62e6fa6c79bef04491eb2f8db6</a></p>
<p> </p>
<div style="COLOR: rgb(33,33,33)">
<hr style="WIDTH: 98%; DISPLAY: inline-block">
<div dir="ltr"><font style="FONT-SIZE: 11pt" color="#000000" face="Calibri, sans-serif"><b>From:</b> mristudio-users <<a href="mailto:mristudio-users-bounces@mristudio.org" target="_blank">mristudio-users-bounces@mristudio.org</a>> on behalf of Radhika Teli
 <<a href="mailto:radhikateli24@gmail.com" target="_blank">radhikateli24@gmail.com</a>><br>
<b>Sent:</b> Monday, April 13, 2015 4:21 PM<br>
<b>To:</b> <a href="mailto:mristudio-users@mristudio.org" target="_blank">mristudio-users@mristudio.org</a><br>
<b>Subject:</b> [Mristudio-users] Importing ROI into Fiber Tracking Function of DTI Studio</font>
<div> </div>
</div>
<div>
<div>
<div>
<div dir="ltr">
<div>Hello,</div>
<div> </div>
<div>I have been segmenting the corpus callosum into six segments in Analyze Software 12.0. Each segment has been saved as an object map and also in Analyze format (.hdr and .img).
</div>
<div> </div>
<div>I am trying to perform tractography of each segment using the Fiber Tracking tool in DTI Studio, but I am unable to load the segments (each ROI) into the Fiber Tracking function. If possible, I would like to avoid tracing each segment in FiberTracking
 because it may alter the accuracy of the data.</div>
<div> </div>
<div>Please let me know if there is a way I can import each of my segments (as ROI) into the FiberTracking tool of DTI Studio in order to perform tractography and obtain FA values.</div>
<div> </div>
<div>Thanks,</div>
<div>Radhika Teli<br clear="all">
<br>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
<br>
_______________________________________________<br>
mristudio-users mailing list<br>
<a href="mailto:mristudio-users@mristudio.org" target="_blank">mristudio-users@mristudio.org</a><br>
<a href="http://lists.mristudio.org/mailman/listinfo/" target="_blank">http://lists.mristudio.org/mailman/listinfo/</a><br>
Unsubscribe, send a blank email to: <a href="mailto:mristudio-users-unsubscribe@mristudio.org" target="_blank">
mristudio-users-unsubscribe@mristudio.org</a><br>
<br>
</blockquote>
</div>
<br>
<br clear="all">
<br>
-- <br>
<div>
<div dir="ltr">
<div>
<div dir="ltr">Radhika Teli
<div>University of Cincinnati College of Medicine 2019</div>
<div><a href="tel:614.517.4656" target="_blank" value="+16145174656">614.517.4656</a></div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
<br>
_______________________________________________<br>
mristudio-users mailing list<br>
<a href="mailto:mristudio-users@mristudio.org">mristudio-users@mristudio.org</a><br>
<a href="http://lists.mristudio.org/mailman/listinfo/" target="_blank">http://lists.mristudio.org/mailman/listinfo/</a><br>
Unsubscribe, send a blank email to: <a href="mailto:mristudio-users-unsubscribe@mristudio.org">
mristudio-users-unsubscribe@mristudio.org</a><br>
<br>
</blockquote>
</div>
<br>
<br clear="all">
<br>
-- <br>
<div class="gmail_signature">
<div dir="ltr">
<div>
<div dir="ltr">Radhika Teli
<div>University of Cincinnati College of Medicine 2019</div>
<div>614.517.4656</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</body>
</html>