<html xmlns:v="urn:schemas-microsoft-com:vml" xmlns:o="urn:schemas-microsoft-com:office:office" xmlns:w="urn:schemas-microsoft-com:office:word" xmlns:m="http://schemas.microsoft.com/office/2004/12/omml" xmlns="http://www.w3.org/TR/REC-html40">
<head>
<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=us-ascii">
<meta name="Generator" content="Microsoft Word 12 (filtered medium)">
<style><!--
/* Font Definitions */
@font-face
        {font-family:Calibri;
        panose-1:2 15 5 2 2 2 4 3 2 4;}
/* Style Definitions */
p.MsoNormal, li.MsoNormal, div.MsoNormal
        {margin:0in;
        margin-bottom:.0001pt;
        font-size:11.0pt;
        font-family:"Calibri","sans-serif";}
a:link, span.MsoHyperlink
        {mso-style-priority:99;
        color:blue;
        text-decoration:underline;}
a:visited, span.MsoHyperlinkFollowed
        {mso-style-priority:99;
        color:purple;
        text-decoration:underline;}
span.EmailStyle17
        {mso-style-type:personal-compose;
        font-family:"Calibri","sans-serif";
        color:windowtext;}
.MsoChpDefault
        {mso-style-type:export-only;}
@page WordSection1
        {size:8.5in 11.0in;
        margin:1.0in 1.0in 1.0in 1.0in;}
div.WordSection1
        {page:WordSection1;}
--></style><!--[if gte mso 9]><xml>
<o:shapedefaults v:ext="edit" spidmax="1026" />
</xml><![endif]--><!--[if gte mso 9]><xml>
<o:shapelayout v:ext="edit">
<o:idmap v:ext="edit" data="1" />
</o:shapelayout></xml><![endif]-->
</head>
<body lang="EN-US" link="blue" vlink="purple">
<div class="WordSection1">
<p class="MsoNormal">Dear Users,<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"><o:p>&nbsp;</o:p></p>
<p class="MsoNormal">I would like to extract information for DTI images such as number of tracts, fiber density, FA, MD values of tracts running between the ROIs (90 ROIs) using AAL ROIs atlas. Could someone tell me how I can do this?<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"><o:p>&nbsp;</o:p></p>
<p class="MsoNormal">Also do you have batch processing facility available to process DTI images? Also can you make DTI studio accept text files for bvec (gradient table). I do some of the pre processing steps in a different software and use DTI studio for tract
 reconstruction so if DTI studio could accept a text file for gradient table field it will be great (now I have to type everytime 0: 0,0,0 1: -0.45,&#8230;. etc). In addition to saving the eigen values and other maps can you also include (automatic or user to check
 option to save all maps right now I believe CP, CL RD doesn&#8217;t get saved and one has to manually save them)<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"><o:p>&nbsp;</o:p></p>
<p class="MsoNormal">Thanks very much<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">Venkat<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"><o:p>&nbsp;</o:p></p>
<p class="MsoNormal"><o:p></o:p></p>
</div>
<br><center><img src="http://www.kesslerfoundation.org/images/emailimages/KFSignature.jpg" alt="Kessler Foundation Signature" width="562" height="77" border="0" /></a>
</center><br />
<center><a href="http://www.facebook.com/?ref=home#!/pages/Kessler-Foundation/123330414345741?sk=info" target="_blank">
<img src="http://www.kesslerfoundation.org/images/emailimages/FaceBook-iconverysmall.png" alt="Kessler Foundation Facebook Page" width="24" height="24" border="0" /></a>

<a href="http://www.youtube.com/user/KesslerFoundation" target="_blank">
<img src="http://www.kesslerfoundation.org/images/emailimages/Youtube-iconverysmall.png" alt="Kessler Foundation You Tube" width="24" height="24" border="0" /></a> 

<a href="http://www.twitter.com/KesslerFound" target="_blank">
<img src="http://www.kesslerfoundation.org/images/emailimages/Twitter-iconverysmall.png" alt="Kessler Foundation Research Twitter Page" width="24" height="24" border="0" /></a><br />
</center><br />

The information in this transmission is intended for official use of the Kessler Foundation.  It is intended for the exclusive use of the persons or entities to which it is addressed.  If you are not an intended recipient or the employee or agent responsible for delivering this transmission to an intended recipient, be aware that any disclosure, dissemination, distribution or copying of this communication, or the use of its contents, is strictly prohibited.  If you received this transmission in error, please notify the sender by return e-mail and delete the material from any computer.

&nbsp;&nbsp;&shy;&shy;&nbsp;&nbsp;</body>
</html>