Hi everybody,<div><br></div><div>I am using the &quot;flags&quot; file to label bad volumes in 3 loaded datasets. After labeling bad volumes, I save the dataset in raw format (all 3 datasets become a single .dat file). I load back the raw format, which now is only 1 long line of volumes, and the flagged volumes do not correspond. As a result, corrupted slices are still visible in FA maps, compromising the study.</div>

<div><br></div><div>I had the impression that the &quot;flags&quot; file can be reloaded on the same dataset, even when saved as raw, but now I am confused. Can you please explain how does a flags work when loaded with a concatenated long dataset? I can send you the par/rec files and the .dat file if necessary.</div>

<div><br></div><div>Thank you and enjoy the weekend.</div><div><br></div><div>Dorian</div><div>Thomas Jefferson University</div>