Let me add little more history.<div><br></div><div>Suppose you do diffusion constant measurement using X, Y, and Z gradient individually. You get three results, diffusion along X (Dx), Y (Dy), and Z (Dz).</div><div><br></div>
<div>When you image an anisotropic sample like brain, Dx, Dy, Dz are not equal.</div><div>Each of these is called &quot;Apparent diffusion constant&quot;. They are &quot;apparent&quot; because depending on the gradient axis you use or the orientation of the sample, they vary.</div>
<div><br></div><div>Then people found that Dx+Dy+Dz is invariant, meaning it stays the same regardless of the sample orientation.</div><div>Dx is rotation-variant because if you use X-gradient and measure the same sample (e.g. a chunk of meat) three times with different orientations, you get different Dx values.</div>
<div><br></div><div>So, Dx+Dy+Dz is a convenient value because you don&#39;t have to worry about consistency of sample orientations. </div><div>Dx+Dy+Dz is called &quot;Trace&quot;. In DtiStudio, we use this &quot;Trace&quot;.</div>
<div><br></div><div>(Dx+Dy+Dz)/3 is called &quot;Mean diffusivity&quot;</div><div><br></div><div>Confusion arises when we start to use &quot;Averaged diffusion constant&quot;, which also is (Dx+Dy+Dz)/3 and the same as &quot;Mean diffusivity&quot;.</div>
<div><br></div><div>When we use the abbreviation, &quot;ADC&quot;, it is not clear if it means &quot;apparent diffusion constant&quot; or &quot;averaged diffusion constant&quot;.</div><div><br></div><div>So, you have to read the context carefully. MD is, in this sense, a better term.<br>
<br><div class="gmail_quote">On Thu, Feb 14, 2013 at 2:46 PM, Abhijit Das <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:adas@kesslerfoundation.org" target="_blank">adas@kesslerfoundation.org</a>&gt;</span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">





<div lang="EN-US" link="blue" vlink="purple">
<div style="direction:ltr;font-size:10pt;font-family:Tahoma">Dear Venkatesh and Hangyi,<br>
You clarified a big confusion for me today. <br>
Thanks,<br>
Abhijit<br>
<div style="font-size:16px;font-family:Times New Roman">
<hr>
<div style="direction:ltr"><font color="#000000" face="Tahoma"><b>From:</b> <a href="mailto:mristudio-users-bounces@mristudio.org" target="_blank">mristudio-users-bounces@mristudio.org</a> [<a href="mailto:mristudio-users-bounces@mristudio.org" target="_blank">mristudio-users-bounces@mristudio.org</a>] on behalf of Hangyi Jiang [<a href="mailto:hjiang@jhmi.edu" target="_blank">hjiang@jhmi.edu</a>]<br>

<b>Sent:</b> Thursday, February 14, 2013 2:44 PM<div><div class="h5"><br>
<b>To:</b> DTI Studio, ROI Editor, DiffeoMap Questions/Support<br>
<b>Subject:</b> Re: [Mristudio-users] difference between ADC and MD<br>
</div></div></font><br>
</div><div><div class="h5">
<div></div>
<div>
<div style="direction:ltr;font-size:10pt;font-family:Tahoma"><br>
some papers may use ADC for Averaging Diffusion Coefficient (<span style="color:#1f497d">synonymously with MD</span>).   We don&#39;t use it in this way, it is so easy to get confused.<br>
<br>
I cannot say it is not right to use ADC as a  synonymous term of MD (language changes all the time, :) ).  but in the very beginning, ADC means
<span style="font-size:10.0pt;font-family:&quot;Tahoma&quot;,&quot;sans-serif&quot;">apparent diffusion coefficient.<br>
<br>
best,<br>
<br>
hangyi<br>
<br>
</span><br>
<br>
<br>
<br>
<div style="font-size:16px;font-family:Times New Roman">
<hr>
<div style="direction:ltr"><font color="#000000" face="Tahoma"><b>From:</b> <a href="mailto:mristudio-users-bounces@mristudio.org" target="_blank">mristudio-users-bounces@mristudio.org</a> [<a href="mailto:mristudio-users-bounces@mristudio.org" target="_blank">mristudio-users-bounces@mristudio.org</a>] on behalf of Venkatesh Rajagopalan [<a href="mailto:VRajagopalan@kesslerfoundation.org" target="_blank">VRajagopalan@kesslerfoundation.org</a>]<br>

<b>Sent:</b> Thursday, February 14, 2013 2:27 PM<br>
<b>To:</b> &#39;DTI Studio, ROI Editor, DiffeoMap Questions/Support&#39;<br>
<b>Subject:</b> Re: [Mristudio-users] difference between ADC and MD<br>
</font><br>
</div>
<div></div>
<div>
<div>
<p class="MsoNormal"><span style="color:#1f497d">Hangyi,</span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="color:#1f497d"> </span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="color:#1f497d">Sorry again though. In some manuscripts ADC is used synonymously with MD, so this is wrong, right?.</span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="color:#1f497d"> </span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="color:#1f497d">Thanks</span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="color:#1f497d">Venkat</span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="color:#1f497d"> </span></p>
<div>
<div style="border:none;border-top:solid #b5c4df 1.0pt;padding:3.0pt 0in 0in 0in">
<p class="MsoNormal"><b><span style="font-size:10.0pt;font-family:&quot;Tahoma&quot;,&quot;sans-serif&quot;">From:</span></b><span style="font-size:10.0pt;font-family:&quot;Tahoma&quot;,&quot;sans-serif&quot;"> <a href="mailto:mristudio-users-bounces@mristudio.org" target="_blank">mristudio-users-bounces@mristudio.org</a> [mailto:<a href="mailto:mristudio-users-bounces@mristudio.org" target="_blank">mristudio-users-bounces@mristudio.org</a>]
<b>On Behalf Of </b>Hangyi Jiang<br>
<b>Sent:</b> Thursday, February 14, 2013 2:12 PM<br>
<b>To:</b> DTI Studio, ROI Editor, DiffeoMap Questions/Support<br>
<b>Subject:</b> Re: [Mristudio-users] difference between ADC and MD</span></p>
</div>
</div>
<p class="MsoNormal"> </p>
<div>
<p class="MsoNormal" style="margin-bottom:12.0pt"><span style="font-size:10.0pt;font-family:&quot;Tahoma&quot;,&quot;sans-serif&quot;">hi,<br>
<br>
apparent diffusion coefficient (ADC) is a measurement for a diffusion weighted image in a specific gradient. its definition is:<br>
<br>
ADC = ln(S/S0) / (-b)<br>
here, S is the gradient weighted image, S0 is the B0 image, b is the b value.<br>
<br>
so, if a data set has 30 gradient orientations, there will be 30 ADCs.  for each gradient, there will be a ADC map for this particular DW-image.<br>
<br>
<br>
mean- diffusivity is defined as the mean value of eigen values (Lamda 1-3) of the tensor ellipsoid:<br>
Mean_Diffusivity = (Lamda_1 + Lamda_2 + Lamda_3) / 3;<br>
<br>
mathematically, this is equal to the average of the diagonal elements of the tensor matrix:<br>
Mean_Diffusivity =  (Dxx + Dyy + Dzz) / 3;<br>
<br>
in noise-free situation (practically, it is impossible), mean-diffusivity is also equal to the mean value of ADCs of the DWI data set.<br>
e.g. given a data set with 30 orientations, then Mean_Diffusivity = (ADC1 + ADC2 + .. ADC30) / 30;<br>
<br>
BTW: the sum of eigen-values or the sum of the diagonal elements of the tensor matrix is called TRACE:<br>
TRACE =  (Lamda_1 + Lamda_2 + Lamda_3) = (Dxx + Dyy + Dzz);<br>
<br>
so, Mean_Diffusivity = TRACE/3;<br>
<br>
<br>
best,<br>
<br>
hangyi<br>
<br>
<br>
<br>
</span></p>
<div>
<div class="MsoNormal" style="text-align:center" align="center"><span style="font-size:12.0pt;font-family:&quot;Times New Roman&quot;,&quot;serif&quot;">
<hr align="center" size="2" width="100%">
</span></div>
<div>
<p class="MsoNormal" style="margin-bottom:12.0pt"><b><span style="font-size:10.0pt;font-family:&quot;Tahoma&quot;,&quot;sans-serif&quot;">From:</span></b><span style="font-size:10.0pt;font-family:&quot;Tahoma&quot;,&quot;sans-serif&quot;">
<a href="mailto:mristudio-users-bounces@mristudio.org" target="_blank">mristudio-users-bounces@mristudio.org</a> [<a href="mailto:mristudio-users-bounces@mristudio.org" target="_blank">mristudio-users-bounces@mristudio.org</a>] on behalf of Venkatesh Rajagopalan [<a href="mailto:VRajagopalan@kesslerfoundation.org" target="_blank">VRajagopalan@kesslerfoundation.org</a>]<br>

<b>Sent:</b> Thursday, February 14, 2013 1:40 PM<br>
<b>To:</b> &#39;DTI Studio, ROI Editor, DiffeoMap Questions/Support&#39;<br>
<b>Subject:</b> [Mristudio-users] difference between ADC and MD</span><span style="font-size:12.0pt;font-family:&quot;Times New Roman&quot;,&quot;serif&quot;"></span></p>
</div>
<div>
<div>
<p class="MsoNormal"><span style>Hi All,</span></p>
<p class="MsoNormal"><span style> </span></p>
<p class="MsoNormal"><span style>I very often come across apparent diffusion coefficient and mean diffusivity being measured in studies. I am wondering what is the difference between these two measures in terms of the formula used.</span></p>

<p class="MsoNormal"><span style> </span></p>
<p class="MsoNormal"><span style>Thanks</span></p>
<p class="MsoNormal"><span style>Venkat</span></p>
</div>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:12.0pt;font-family:&quot;Times New Roman&quot;,&quot;serif&quot;"><br>
Kessler Foundation is proud to be recognized as one of the Best Places to Work in New Jersey.
</span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:12.0pt;font-family:&quot;Times New Roman&quot;,&quot;serif&quot;"> </span></p>
<p class="MsoNormal" style="text-align:center" align="center"><span style="font-size:12.0pt;font-family:&quot;Times New Roman&quot;,&quot;serif&quot;"><a href="http://www.facebook.com/?ref=home#!/pages/Kessler-Foundation/123330414345741?sk=info" target="_blank"><span style="text-decoration:none"><img alt="Kessler Foundation Facebook Page" border="0" height="24" width="24"></span></a><a href="http://www.youtube.com/user/KesslerFoundation" target="_blank"><span style="text-decoration:none"><img alt="Kessler Foundation You Tube" border="0" height="24" width="24"></span></a><a href="http://www.twitter.com/KesslerFound" target="_blank"><span style="text-decoration:none"><img alt="Kessler Foundation Research Twitter Page" border="0" height="24" width="24"></span></a></span></p>

<p class="MsoNormal"><span style="font-size:12.0pt;font-family:&quot;Times New Roman&quot;,&quot;serif&quot;"><br>
The information in this transmission is intended for official use of the Kessler Foundation. It is intended for the exclusive use of the persons or entities to which it is addressed. If you are not an intended recipient or the employee or agent responsible
 for delivering this transmission to an intended recipient, be aware that any disclosure, dissemination, distribution or copying of this communication, or the use of its contents, is strictly prohibited. If you received this transmission in error, please notify
 the sender by return e-mail and delete the material from any computer.   ­­   </span>
</p>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div></div></div>
</div><div><div class="h5">
<br>Kessler Foundation is proud to be recognized as one of the Best Places to Work in New Jersey.

<br>

<center><a href="http://www.facebook.com/?ref=home#!/pages/Kessler-Foundation/123330414345741?sk=info" target="_blank">

<img alt="Kessler Foundation Facebook Page" width="24" height="24" border="0"></a>



<a href="http://www.youtube.com/user/KesslerFoundation" target="_blank">

<img alt="Kessler Foundation You Tube" width="24" height="24" border="0"></a> 



<a href="http://www.twitter.com/KesslerFound" target="_blank">

<img alt="Kessler Foundation Research Twitter Page" width="24" height="24" border="0"></a><br>

</center><br>



The information in this transmission is intended for official use of the Kessler Foundation.  It is intended for the exclusive use of the persons or entities to which it is addressed.  If you are not an intended recipient or the employee or agent responsible for delivering this transmission to an intended recipient, be aware that any disclosure, dissemination, distribution or copying of this communication, or the use of its contents, is strictly prohibited.  If you received this transmission in error, please notify the sender by return e-mail and delete the material from any computer.
  ­­  </div></div></div>

<br>_______________________________________________<br>
mristudio-users mailing list<br>
<a href="mailto:mristudio-users@mristudio.org">mristudio-users@mristudio.org</a><br>
<a href="http://lists.mristudio.org/mailman/listinfo/" target="_blank">http://lists.mristudio.org/mailman/listinfo/</a><br>
Unsubscribe, send a blank email to: <a href="mailto:mristudio-users-unsubscribe@mristudio.org">mristudio-users-unsubscribe@mristudio.org</a><br>
<br></blockquote></div><br></div>