Hi all,<div><br></div><div>I am trying to do atlas based tract reconstruction based on Zhang Yajing (2010) paper. I have performed LDDMM and need to backproject a Template Roi Set (say the uncinate). The files in the TRS look like this: </div>

<div><br></div><div><div>ROI_display.roihdr</div><div>AND_#1.dat</div><div>NOT.dat</div><div>OR.dat</div><div>ROI_display.dat</div></div><div><br></div><div>I tried loading the these files in Diffeomap but there are no white pixels, all black. So, how ca I do this back projection?</div>

<div><br></div><div><br></div><div>And is there an automatic way to massively invert TRS&#39;s in native space or do I have to go one by one for each TRS to open and save in Diffeomap.</div><div><br></div><div><br></div>
<div>
Thank you.</div>