<div style="line-height:1.7;color:#000000;font-size:14px;font-family:arial"><DIV>Hello,everyone,</DIV>
<DIV>&nbsp;&nbsp;&nbsp;I used ditstudio to produce FA,&nbsp; and then used a VBA method to find a decreased FA brain region in my paper, but the referee asked a question, i don't know what it mean( the contents in yellow), who can tell me. thank you very much! </DIV>
<DIV>&nbsp;</DIV>
<DIV>
<P style="TEXT-JUSTIFY: inter-ideograph; BACKGROUND: white; TEXT-ALIGN: justify"><SPAN lang="EN-US" style="FONT-SIZE: 14pt; COLOR: #000033; FONT-FAMILY: Verdana">"Second, is it possible that the higher FA in the recovered scans is due to better quality of the scans? Maybe due to reduced movement artifact (coorelated with BDI)? Is it possible that simple filtering followed by VBA is more sensitive to such an artifact than TBSS would have been? <SPAN style="BACKGROUND: yellow; mso-highlight: yellow">Is this effect filter frequency dependent?"</SPAN><o:p></o:p></SPAN></P></DIV>
<DIV>&nbsp;</DIV>
<DIV><BR>&nbsp;</DIV>
<DIV></DIV><BR>ÔÚ 2011-08-26 04:48:40£¬"susumu&nbsp;mori"&nbsp;&lt;susumu@mri.jhu.edu&gt; Ð´µÀ£º<BR>
<BLOCKQUOTE id="isReplyContent" style="PADDING-LEFT: 1ex; MARGIN: 0px 0px 0px 0.8ex; BORDER-LEFT: #ccc 1px solid">I have to confirm Hangyi, but my understanding is;<BR><BR>
<DIV class="gmail_quote">
<BLOCKQUOTE class="gmail_quote" style="PADDING-LEFT: 1ex; MARGIN: 0px 0px 0px 0.8ex; BORDER-LEFT: #ccc 1px solid">
<DIV style="FONT-SIZE: 13px; FONT-FAMILY: Tahoma, sans-serif"><BR>Slice&nbsp; <BR>#_Of_Fibers: the number of reconstructed streamlines that penetrate the given slice<BR>Max_Val: The maximum pixel value (if you chose FA, then the FA value) that contains the streamlines in the given slice<BR>Min_Val<BR>Mean_Val: The mean of the pixel values that contain the streamlines in the given slice<BR>Std_Dev<BR><BR>Pixel#--: The number of pixels that contain the streamlines in the given slice<BR>Max#-- &nbsp; &nbsp; &nbsp;: The maximum number of the streamlines a pixel holds in the given slice<BR>Min#--&nbsp; <BR>Mean#-- &nbsp; &nbsp; The mean number of the streamlines of the pixels that contain the streamlines in the given slice<BR>Std_Dev-- (Fiber/Pixel)<BR><BR><BR><BR>Inorder to calculate a mean FA for a selected number of slices, would the following be correct?: (ie for slice 1, 2, 3...)<BR></DIV></BLOCKQUOTE>
<DIV><BR></DIV>
<DIV>This number is already calculated in "Mean Val" column.&nbsp;</DIV>
<BLOCKQUOTE class="gmail_quote" style="PADDING-LEFT: 1ex; MARGIN: 0px 0px 0px 0.8ex; BORDER-LEFT: #ccc 1px solid">
<DIV style="FONT-SIZE: 13px; FONT-FAMILY: Tahoma, sans-serif"><BR>((Pixel#)(Mean_val))1+((Pixel#)(Mean_val))2+((Pixel#)(Mean_val))3.......&nbsp; / total # of pixels<BR><BR><BR>Or....<BR><BR>((#_Of_Fibers)(Mean_val))1+((#_Of_Fibers)(Mean_val))2+((#_Of_Fibers)(Mean_val))3.......&nbsp; / total #_Of_Fibers<BR><BR><BR><BR>Also, could you possibly explain what the rest of the values are? (especially beyond pixel #)<BR><BR>Thank you again, I really appreciate the help<BR>Matt Gnirke<BR><BR><BR><U></U><U></U></DIV><BR>_______________________________________________<BR>mristudio-users mailing list<BR><A href="mailto:mristudio-users@mristudio.org">mristudio-users@mristudio.org</A><BR><A href="http://lists.mristudio.org/mailman/listinfo/" target="_blank">http://lists.mristudio.org/mailman/listinfo/</A><BR>Unsubscribe, send a blank email to: <A href="mailto:mristudio-users-unsubscribe@mristudio.org">mristudio-users-unsubscribe@mristudio.org</A><BR><BR></BLOCKQUOTE></DIV><BR></BLOCKQUOTE></div><br><br><span title="neteasefooter"><span id="netease_mail_footer"></span></span>