If your Nifty format was compressed (filename.nii.gz), DTI studio will complain.<br>Try to use uncompressed version. It will work. If not, your file might be corrupted.<br><br>Good luck!<br>SC <br><br><div class="gmail_quote">
On Tue, Jun 7, 2011 at 4:41 PM, Supreet kaur <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:ksupreet6@gmail.com">ksupreet6@gmail.com</a>&gt;</span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex;">
<div>hello all,</div>
<div>               My data is already in NIFTI format (.nii.gz); since I want to process the data for the fiber segmentation using fiber tracking in the</div>
<div>DTI studio. I converted the data into the analyze format and REC format. But I need to do DTI mapping, I am not able to load either of these two </div>
<div>file formats for DTI mapping. </div>
<div>Could you guys provide your useful feedback and help on this. I&#39;ll appreciate your help as this  is urgent.</div>
<div>Thanks</div>
<div>Supreet<br><br><br></div>
<div class="gmail_quote"><div><div></div><div class="h5">On Tue, Jun 7, 2011 at 3:41 PM, Gilberto Alves <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:gsalves123@hotmail.com" target="_blank">gsalves123@hotmail.com</a>&gt;</span> wrote:<br>

</div></div><blockquote style="border-left:#ccc 1px solid;margin:0px 0px 0px 0.8ex;padding-left:1ex" class="gmail_quote"><div><div></div><div class="h5">
<div>HI Supreet, <br> <br>If you say your data is in REC format, you need to convert these files to the Nifti format (.nii.gz). <br>This can be easily done with some softwares. <br>I recommend MRI cron. You can download it for free. Drag all files to the directory dcm2niigui and you will have the conversion. <br>

 <br>Cheers,<br> <br>Gilberto Sousa Alves <br> <br>
<hr>
Date: Tue, 7 Jun 2011 13:48:07 -0400<br>From: <a href="mailto:ksupreet6@gmail.com" target="_blank">ksupreet6@gmail.com</a> 
<div><br>To: <a href="mailto:mristudio-users@mristudio.org" target="_blank">mristudio-users@mristudio.org</a><br></div>Subject: [Mristudio-users] problem processing the NIFTI file 
<div>
<div></div>
<div><br><br>
<div>hi</div>
<div>          I have a problem processing the NIFTI file. I save the images in the files in the .REC format, </div>
<div>the problem comes when I try to process those raw files to DTI mapping, it gives me an error file.</div>
<div>PLease help me on this.</div>
<div>I&#39;ll appreciate your reply.</div>
<div> </div>
<div>Thanks,<br clear="all"><br>-- <br>Sincerely,<br><br>Supreet kaur<br><br></div><br></div></div>_______________________________________________ mristudio-users mailing list <a href="mailto:mristudio-users@mristudio.org" target="_blank">mristudio-users@mristudio.org</a> <a href="http://lists.mristudio.org/mailman/listinfo/" target="_blank">http://lists.mristudio.org/mailman/listinfo/</a><span onmouseout="cancel = false; window.setTimeout(WRCHideContent, 1000);" onmouseover="WRCShowContent({&#39;rating&#39;:{&#39;value&#39;:-1,&#39;weight&#39;:-1},&#39;flags&#39;:{},&#39;ttl&#39;:3600,&#39;expireTime&#39;:&#39;20110606184429&#39;}, this.className);" class="wrc0" style="padding-right: 16px; width: 16px; height: 16px;"></span> Unsubscribe, send a blank email to: <a href="mailto:mristudio-users-unsubscribe@mristudio.org" target="_blank">mristudio-users-unsubscribe@mristudio.org</a> </div>

<br></div></div>_______________________________________________<div class="im"><br>mristudio-users mailing list<br><a href="mailto:mristudio-users@mristudio.org" target="_blank">mristudio-users@mristudio.org</a><br><a href="http://lists.mristudio.org/mailman/listinfo/" target="_blank">http://lists.mristudio.org/mailman/listinfo/</a><span onmouseout="cancel = false; window.setTimeout(WRCHideContent, 1000);" onmouseover="WRCShowContent({&#39;rating&#39;:{&#39;value&#39;:-1,&#39;weight&#39;:-1},&#39;flags&#39;:{},&#39;ttl&#39;:3600,&#39;expireTime&#39;:&#39;20110606184429&#39;}, this.className);" class="wrc0" style="padding-right: 16px; width: 16px; height: 16px;"></span><br>

Unsubscribe, send a blank email to: <a href="mailto:mristudio-users-unsubscribe@mristudio.org" target="_blank">mristudio-users-unsubscribe@mristudio.org</a><br><br></div></blockquote></div><br><br clear="all"><br>-- <br>
Sincerely,<br><font color="#888888"><br>Supreet kaur<br>
<br>
</font><br>_______________________________________________<br>
mristudio-users mailing list<br>
<a href="mailto:mristudio-users@mristudio.org">mristudio-users@mristudio.org</a><br>
<a href="http://lists.mristudio.org/mailman/listinfo/" target="_blank">http://lists.mristudio.org/mailman/listinfo/</a><span onmouseout="cancel = false; window.setTimeout(WRCHideContent, 1000);" onmouseover="WRCShowContent({&#39;rating&#39;:{&#39;value&#39;:-1,&#39;weight&#39;:-1},&#39;flags&#39;:{},&#39;ttl&#39;:3600,&#39;expireTime&#39;:&#39;20110606184429&#39;}, this.className);" class="wrc0" style="padding-right: 16px; width: 16px; height: 16px;"></span><br>

Unsubscribe, send a blank email to: <a href="mailto:mristudio-users-unsubscribe@mristudio.org">mristudio-users-unsubscribe@mristudio.org</a><br>
<br></blockquote></div><br>