Hi,<br><br> I am new to the field of DTI. I am trying to use probability atlas for some data analysis.<br> I downloaded the JHU atlas from the FSL website.<br> There are 2 JHU White matter atlases.<br> 1)JHU ICBM-DTI-81 White-Matter Labels<br>
 2) JHU White-Matter Tractography Atlas<br><br> From what I understand JHU White-Matter Tractography Atlas, is a probability atlas.<br> So, for every voxel in each tract (20 tracts) specified  there should be a 0 to 1 probability value.<br>
 This probability will determine the probability of that voxel belonging to that particular tract.<br> But, where could I find the probability values?    <br> When I use DTIStudio to open the atlas, all I could see as the intensity are the indexes that are given for each tract.<br>
<br><ul><li> Please let me know if I am using the wrong atlas?</li></ul>           (or) How I could find the probability values of the tracts?<br> <br><ul><li> What is the difference between these files JHU-ICBM-tracts-maxprob-thr50-2mm.nii.gz  and <br>
</li></ul>           JHU-ICBM-tracts-maxprob-thr25-2mm.nii.gz<br><br>Thanks in advance.<br><br><br> <br> <br>