Hi,<br><br>�I am new to the field of DTI. I am trying to use probability atlas for some data analysis.<br>�I downloaded the JHU atlas from the FSL website.<br>�There are 2 JHU White matter atlases.<br>�1)JHU ICBM-DTI-81 White-Matter Labels<br>
�2) JHU White-Matter Tractography Atlas<br><br>�From what I understand JHU White-Matter Tractography Atlas, is a probability atlas.<br>�So, for every voxel in each tract (20 tracts) specified� there should be a 0 to 1 probability value.<br>
�This probability will determine the probability of that voxel belonging to that particular tract.<br>�But, where could I find the probability values?��� <br>�When I use DTIStudio to open the atlas, all I could see as the intensity are the indexes that are given for each tract.<br>
<br><ul><li>�Please let me know if I am using the wrong atlas?</li></ul>���������� (or) How I could find the probability values of the tracts?<br>�<br><ul><li>�What is the difference between these files JHU-ICBM-tracts-maxprob-thr50-2mm.nii.gz� and <br>
</li></ul>���������� JHU-ICBM-tracts-maxprob-thr25-2mm.nii.gz<br><br>Thanks in advance.<br><br><br>�<br>�<br>