<html xmlns:v="urn:schemas-microsoft-com:vml" xmlns:o="urn:schemas-microsoft-com:office:office" xmlns:w="urn:schemas-microsoft-com:office:word" xmlns:m="http://schemas.microsoft.com/office/2004/12/omml" xmlns="http://www.w3.org/TR/REC-html40">

<head>
<META HTTP-EQUIV="Content-Type" CONTENT="text/html; charset=us-ascii">
<meta name=Generator content="Microsoft Word 12 (filtered medium)">
<style>
<!--
 /* Font Definitions */
 @font-face
        {font-family:Calibri;
        panose-1:2 15 5 2 2 2 4 3 2 4;}
@font-face
        {font-family:Tahoma;
        panose-1:2 11 6 4 3 5 4 4 2 4;}
 /* Style Definitions */
 p.MsoNormal, li.MsoNormal, div.MsoNormal
        {margin:0in;
        margin-bottom:.0001pt;
        font-size:12.0pt;
        font-family:"Times New Roman","serif";}
a:link, span.MsoHyperlink
        {mso-style-priority:99;
        color:blue;
        text-decoration:underline;}
a:visited, span.MsoHyperlinkFollowed
        {mso-style-priority:99;
        color:purple;
        text-decoration:underline;}
span.EmailStyle17
        {mso-style-type:personal-reply;
        font-family:"Calibri","sans-serif";
        color:#1F497D;}
.MsoChpDefault
        {mso-style-type:export-only;}
@page WordSection1
        {size:8.5in 11.0in;
        margin:1.0in 1.0in 1.0in 1.0in;}
div.WordSection1
        {page:WordSection1;}
-->
</style>
<!--[if gte mso 9]><xml>
 <o:shapedefaults v:ext="edit" spidmax="1026" />
</xml><![endif]--><!--[if gte mso 9]><xml>
 <o:shapelayout v:ext="edit">
  <o:idmap v:ext="edit" data="1" />
 </o:shapelayout></xml><![endif]-->
</head>

<body lang=EN-US link=blue vlink=purple>

<div class=WordSection1>

<p class=MsoNormal><span style='font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";
color:#1F497D'>Yesterday at 3 pm we did the initial multichannel LDDMM and
typed my email.&nbsp; In the tutorial, they said results are emailed in 30 min &#8211; 5 hours.&nbsp;
Is this an accurate time frame?&nbsp; Is there a contact if we have not received a
reply email in &gt;15 hours? Thank you. sarah<o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal><span style='font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";
color:#1F497D'><o:p>&nbsp;</o:p></span></p>

<div style='border:none;border-top:solid #B5C4DF 1.0pt;padding:3.0pt 0in 0in 0in'>

<p class=MsoNormal><b><span style='font-size:10.0pt;font-family:"Tahoma","sans-serif"'>From:</span></b><span
style='font-size:10.0pt;font-family:"Tahoma","sans-serif"'>
mristudio-users-bounces@mristudio.org
[mailto:mristudio-users-bounces@mristudio.org] <b>On Behalf Of </b>susumu mori<br>
<b>Sent:</b> Wednesday, July 21, 2010 8:34 AM<br>
<b>To:</b> DTI Studio, ROI Editor, DiffeoMap Questions/Support<br>
<b>Subject:</b> Re: [Mristudio-users] difference between JHU_MNI_SS_FA and
JHU_MNI_SS_FA_ss<o:p></o:p></span></p>

</div>

<p class=MsoNormal><o:p>&nbsp;</o:p></p>

<p class=MsoNormal style='margin-bottom:12.0pt'>&quot;SS&quot; means
&quot;single-subject&quot;, while &quot;ss&quot; means &quot;skull
stripped&quot;.<br>
<br>
Sorry for the confusing nomenclature.<br>
If your data is skull stripped, you should use &quot;ss&quot; atlas.<br>
Usually linear transformation works between non-skull stripped data. However,
sometimes some extra signal such as sinus interferes with the registration. In
this case, you may need to do registration between skull-stripped images.<br>
For LDDMM, it is safe to use skull-stripped images.<o:p></o:p></p>

<div>

<p class=MsoNormal>On Tue, Jul 20, 2010 at 5:44 PM, Josselin &lt;<a
href="mailto:j.houenou@yahoo.fr">j.houenou@yahoo.fr</a>&gt; wrote:<o:p></o:p></p>

<p class=MsoNormal>Hi,<br>
In many files provided, some have the letters &quot;_ss&quot; attached to them.
What does it mean ? e.g. what's the difference between JHU_MNI_SS_FA and
JHU_MNI_SS_FA_ss ?<br>
thanks,<br>
Josselin<br>
<br>
<br>
<br>
<br>
<br>
_______________________________________________<br>
mristudio-users mailing list<br>
<a href="mailto:mristudio-users@mristudio.org">mristudio-users@mristudio.org</a><br>
<a href="http://lists.mristudio.org/mailman/listinfo/" target="_blank">http://lists.mristudio.org/mailman/listinfo/</a><br>
Unsubscribe, send a blank email to: <a
href="mailto:mristudio-users-unsubscribe@mristudio.org">mristudio-users-unsubscribe@mristudio.org</a><o:p></o:p></p>

</div>

<p class=MsoNormal><o:p>&nbsp;</o:p></p>

</div>

<font face="monospace"><br>
<br>
<br>
Disclaimer:<br>
The materials in this e-mail are private and may contain Protected Health Information. Please note that e-mail is not necessarily confidential or secure. Your use of e-mail constitutes your acknowledgment of these confidentiality and security limitations. If you are not the intended recipient, be advised that any unauthorized use, disclosure, copying, distribution, or the taking of any action in reliance on the contents of this information is strictly prohibited. If you have received this e-mail in error, please immediately notify the sender via telephone or return e-mail.</font></body>

</html>