Thanks a lot.  Appreciate it very much. <br><br>BTW: Another question in the DTI Studio, is it possible to place the ROI at the center of the crosshairs without offset? <br><br>Minjie<br><br>On Mon, Jun 28, 2010 at 3:44 PM, Xin Li <span dir="ltr"><<a href="mailto:xli16@jhmi.edu">xli16@jhmi.edu</a>></span> wrote:<br>
<div class="gmail_quote"><blockquote class="gmail_quote" style="margin: 0pt 0pt 0pt 0.8ex; border-left: 1px solid rgb(204, 204, 204); padding-left: 1ex;">Sorry. it should be "the ROI boundary" not "the voxel boundary".<br>
<div class="im"><br>
<br>
Xin<br>
<br>
<br>
<br>
----- Original Message -----<br>
From: Minjie Wu <<a href="mailto:minjiewu@gmail.com">minjiewu@gmail.com</a>><br>
</div><div class="im">Date: Monday, June 28, 2010 3:45 pm<br>
</div><div class="im">Subject: Re: [Mristudio-users] define ROI in DTI Studio and ROI Editor<br>
</div><div class="im">To: "DTI Studio, ROI Editor, DiffeoMap Questions/Support" <<a href="mailto:mristudio-users@mristudio.org">mristudio-users@mristudio.org</a>><br>
<br>
<br>
> Hello Xin,<br>
><br>
>  I have created two ellipsis ROIs of the same size (4x4). The one on<br>
> the left<br>
>  is added to an object, and the one on the right is not added to an object.<br>
>  The object looks like an arrow instead of an ellipsis. Please see the<br>
>  screenshot through the link.<br>
><br>
><br>
><br>
</div><div><div></div><div class="h5">>  Thanks,<br>
>  Minjie<br>
><br>
>  On Mon, Jun 28, 2010 at 1:47 PM, Xin Li <<a href="mailto:xli16@jhmi.edu">xli16@jhmi.edu</a>> wrote:<br>
><br>
>  > Hello Minjie,<br>
>  ><br>
>  > May I ask what you mean about "ellipsis no longer looks like ellipsis"?<br>
>  ><br>
>  ><br>
>  > Xin<br>
>  ><br>
>  ><br>
>  > ----- Original Message -----<br>
>  > From: Minjie Wu <<a href="mailto:minjiewu@gmail.com">minjiewu@gmail.com</a>><br>
>  > Date: Monday, June 28, 2010 1:45 pm<br>
>  > Subject: [Mristudio-users] define ROI in DTI Studio and ROI Editor<br>
>  > To: <a href="mailto:mristudio-users@mristudio.org">mristudio-users@mristudio.org</a><br>
>  ><br>
>  ><br>
>  > > Hello All,<br>
>  > ><br>
>  > >  We need to measure FA in the substantia nigra (SN) in our<br>
> project. Small<br>
>  > >  ellipse ROIs (4x4) are placed in these area using DTI Studio and<br>
> ROI<br>
>  > > Editor<br>
>  > >  respectively.<br>
>  > ><br>
>  > >  1. For DTI Studio, the ROI is not placed at the center of the<br>
>  > crosshairs,<br>
>  > >  but instead there is an offset. Is there any way to fix or<br>
> adjust this?<br>
>  > ><br>
>  > >  2. For ROI Editor, the ellipsis ROI (4x4) is placed in SN, and the<br>
>  > location<br>
>  > >  of the ROI can be adjusted, then added to an object. However<br>
> once the<br>
>  > >  ellipsis ROI is combined to an object, ellipsis no longer looks<br>
> like<br>
>  > >  ellipsis. Is there any way to avoid this?<br>
>  > ><br>
>  > >  Thank you very much.<br>
>  > ><br>
>  > >  Sincerely,<br>
>  > ><br>
>  > >  --<br>
>  > >  Minjie Wu, PhD<br>
>  > >  Department of Neurology<br>
>  > >  Northwestern University<br>
>  > >  710 N Lake Shore Dr<br>
>  > >  Abbott Hall, 11th floor, Suite 1107<br>
>  > >  Chicago IL 60611<br>
>  > >  Phone: 312-503-1522<br>
>  > > _______________________________________________<br>
>  > >  Mristudio-users mailing list<br>
>  > >  <a href="mailto:Mristudio-users@mristudio.org">Mristudio-users@mristudio.org</a><br>
>  > ><br>
>  > >  Unsubscribe, send a blank email to:<br>
>  > <a href="mailto:Mristudio-users-unsubscribe@mristudio.org">Mristudio-users-unsubscribe@mristudio.org</a><br>
>  > _______________________________________________<br>
>  > Mristudio-users mailing list<br>
>  > <a href="mailto:Mristudio-users@mristudio.org">Mristudio-users@mristudio.org</a><br>
>  ><br>
</div></div><div><div></div><div class="h5">>  > Unsubscribe, send a blank email to:<br>
>  > <a href="mailto:Mristudio-users-unsubscribe@mristudio.org">Mristudio-users-unsubscribe@mristudio.org</a><br>
>  ><br>
><br>
><br>
><br>
>  --<br>
>  Minjie Wu, PhD<br>
>  Department of Neurology<br>
>  Northwestern University<br>
>  710 N Lake Shore Dr<br>
>  Abbott Hall, 11th floor, Suite 1107<br>
>  Chicago IL 60611<br>
>  Phone: 312-503-1522<br>
> _______________________________________________<br>
>  Mristudio-users mailing list<br>
>  <a href="mailto:Mristudio-users@mristudio.org">Mristudio-users@mristudio.org</a><br>
><br>
>  Unsubscribe, send a blank email to: <a href="mailto:Mristudio-users-unsubscribe@mristudio.org">Mristudio-users-unsubscribe@mristudio.org</a><br>
_______________________________________________<br>
Mristudio-users mailing list<br>
<a href="mailto:Mristudio-users@mristudio.org">Mristudio-users@mristudio.org</a><br>
<a href="http://lists.mristudio.org/mailman/listinfo/" target="_blank">http://lists.mristudio.org/mailman/listinfo/</a><br>
Unsubscribe, send a blank email to: <a href="mailto:Mristudio-users-unsubscribe@mristudio.org">Mristudio-users-unsubscribe@mristudio.org</a><br>
</div></div></blockquote></div><br><br clear="all"><br>