<DIV></DIV>
<DIV></DIV>
<P>Thanks,I will tell the result if I have some progress.</P>
<P><BR>在2010-04-29 22:07:54,"Naama Barnea-Goraly" &lt;naamab@stanford.edu&gt; 写道:<BR></P>
<BLOCKQUOTE id="isReplyContent" style="PADDING-LEFT: 1ex; MARGIN: 0px 0px 0px 0.8ex; BORDER-LEFT: #ccc 1px solid">
<DIV><BR></DIV>
<DIV>We are using VB15. Like Susumu said, the Siemens scanner recalculates the gradient table slightly per each subject, and the revised table is in the header (but it is not obvious).&nbsp;You can get that information from the header using MRIconvert (you still have to edit it to dtistudio format). &nbsp;</DIV>
<DIV><BR></DIV>
<DIV>Naama</DIV>
<DIV><BR></DIV><BR>
<DIV>
<DIV>On Apr 29, 2010, at 5:17 AM, susumu mori wrote:</DIV><BR class="Apple-interchange-newline">
<BLOCKQUOTE type="cite">Hi Mark,<BR><BR>If you are using the standard Siemens 12-orientation scheme or other pre-defined tables available in the scanner, we have a file that contains all tables. It seems that Siemens Mosaic/Dicom contains some gradient orientation information, but we still haven't completely figured out how to use them. There are several important points you need to know.<BR><BR>1) Here is the usual 12 orientations in DtiStudio format (you can cut&amp;paste);<BR>0: 0, 0, 0<BR>1:&nbsp; 1.000000, 0.414250, -0.414250 <BR>2:&nbsp; 1.000000, -0.414250, -0.414250 <BR>3:&nbsp; 1.000000, -0.414250, 0.414250 <BR>4:&nbsp; 1.000000, 0.414250, 0.414250<BR>5:&nbsp; 0.414250, 0.414250, 1.000000<BR>6:&nbsp; 0.414250, 1.000000, 0.414250<BR>7:&nbsp; 0.414250, 1.000000, -0.414250<BR>8:&nbsp; 0.414250, 0.414250, -1.000000<BR>9:&nbsp; 0.414250, -0.414250, -1.000000<BR>10:&nbsp; 0.414250, -1.000000, -0.414250<BR>11:&nbsp; 0.414250, -1.000000, 0.414250<BR>12:&nbsp; 0.414250, -0.414250, 1.000000<BR><BR>2) Some old operating system uses different types of the tables. So the current table may not work. If you find a problem with the above table, please let us know.<BR><BR>3) If you are using another pre-defined table, please refer to the attached file. This lists all the tables in VB13 (and after, I believe). You need to convert the format to DtiStudio format. If you look at the 20-orientation scheme in the file, you can find that I converted the Siemens format to the DtiStudio format.<BR><BR>4) Unless you are using VB15, the gradient table needs to be recalculated when you use oblique-plane imaging. VB15 does it automatically and you don't have to worry. With older operating systems, you need to click "Rotate Gradient if Applicable" checkbox in the initial parameter input window of DtiStudio.<BR><BR>Susumu<BR><BR>
<DIV class="gmail_quote">2010/4/29 wgh0805 <SPAN dir="ltr">&lt;<A href="mailto:wgh0805@126.com">wgh0805@126.com</A>&gt;</SPAN><BR>
<BLOCKQUOTE class="gmail_quote" style="PADDING-LEFT: 1ex; MARGIN: 0pt 0pt 0pt 0.8ex; BORDER-LEFT: rgb(204,204,204) 1px solid">
<DIV>Dear all:</DIV>
<DIV>&nbsp;</DIV>
<DIV>
<DIV>&nbsp; I&nbsp;have the data of <SPAN lang="EN-US" style="FONT-SIZE: 10pt; FONT-FAMILY: 'Times New Roman'"><B>Siemens DICOM</B></SPAN>&nbsp;,but I can not find the gradient table for it. How can I find it?</DIV>
<DIV>Thanks ,</DIV>
<DIV><BR></DIV>
<DIV>Mark<BR><BR></DIV></DIV><BR><BR><SPAN title="neteasefooter"></SPAN>
<HR>
<A href="http://ym.163.com/?from=od3" target="_blank">网易为中小企业免费提供企业邮箱(自主域名)</A> <BR>_______________________________________________<BR>Mristudio-users mailing list<BR><A href="mailto:Mristudio-users@mristudio.org">Mristudio-users@mristudio.org</A><BR><A href="http://lists.mristudio.org/mailman/listinfo/" target="_blank">http://lists.mristudio.org/mailman/listinfo/</A><BR>Unsubscribe, send a blank email to: <A href="mailto:Mristudio-users-unsubscribe@mristudio.org">Mristudio-users-unsubscribe@mristudio.org</A><BR><BR></BLOCKQUOTE></DIV><BR><SPAN>&lt;VB13_directions.txt&gt;</SPAN>_______________________________________________<BR>Mristudio-users mailing list<BR><A href="mailto:Mristudio-users@mristudio.org">Mristudio-users@mristudio.org</A><BR>http://lists.mristudio.org/mailman/listinfo/<BR>Unsubscribe, send a blank email to: <A href="mailto:Mristudio-users-unsubscribe@mristudio.org">Mristudio-users-unsubscribe@mristudio.org</A><BR></BLOCKQUOTE></DIV><BR>
<DIV><SPAN class="Apple-style-span" style="WORD-SPACING: 0px; FONT: 12px Helvetica; TEXT-TRANSFORM: none; COLOR: rgb(0,0,0); TEXT-INDENT: 0px; WHITE-SPACE: normal; LETTER-SPACING: normal; BORDER-COLLAPSE: separate; orphans: 2; widows: 2; webkit-border-horizontal-spacing: 0px; webkit-border-vertical-spacing: 0px; webkit-text-decorations-in-effect: none; webkit-text-size-adjust: auto; webkit-text-stroke-width: 0">
<DIV style="WORD-WRAP: break-word; webkit-nbsp-mode: space; webkit-line-break: after-white-space">
<DIV>
<DIV>Naama Barnea-Goraly M.D.</DIV>
<DIV>Instructor</DIV>
<DIV>Center for Interdisciplinary Brain Sciences Research</DIV>
<DIV>Stanford University Division of Child and Adolescent Psychiatry</DIV>
<DIV>401 Quarry Rd. MC 5795</DIV>
<DIV>Stanford University School of Medicine</DIV>
<DIV>Stanford, CA&nbsp; 94305-5795</DIV>
<DIV>Phone: (650) 736-1874, fax: (650) 724-4794</DIV>
<DIV><BR></DIV>
<DIV><BR></DIV>
<DIV>CONFIDENTIALITY NOTICE:&nbsp; This e-mail communication and any attachments may contain confidential information for the use of the designated recipients named above.&nbsp; If you are not the intended recipient, you are hereby notified that you have received this communication in error and that any review, disclosure, dissemination, distribution or copying of it or its contents is prohibited.&nbsp; If you have received this communication in error, please notify Stanford Medical Center immediately by telephone at (650) 725-5722 and destroy all copies of this communication and any attachments.&nbsp; Thank you.</DIV>
<DIV><BR></DIV></DIV></DIV></SPAN><BR class="Apple-interchange-newline"></DIV><BR></BLOCKQUOTE><br><br><span title="neteasefooter"/><hr/>
<a href="http://ym.163.com/?from=od3" target="_blank">网易为中小企业免费提供企业邮箱(自主域名)</a>
</span>