<HTML>
<HEAD>
<TITLE>Re: [Mristudio-users] reading .hdr .img files</TITLE>
</HEAD>
<BODY>
<FONT FACE="Calibri, Verdana, Helvetica, Arial"><SPAN STYLE='font-size:11pt'>I would avoid ANALYZE format in DtiStudio as the .hdr does not store enough info to display R/L, and sometimes other directions, properly (DtiStudio uses radiological convention- R is L).<BR>
<BR>
DtiStudio has motion correction algorithms (e.g., AIR)- see new posted doc on website under User manual, DtiStudio, 3.0.2 new features, DtiStudioUpdate.doc. New version (3.0.2) has multiple options; beta version only one (AIR).<BR>
<BR>
-Julie<BR>
<BR>
Julie E. McEntee, MA, CCRP<BR>
Senior Research Program Coordinator<BR>
Department of Psychiatry- Neuroimaging<BR>
Johns Hopkins University School of Medicine<BR>
600 N. Wolfe St./Phipps 300<BR>
Baltimore, MD 21287<BR>
Phone: 410-502-0468<BR>
Fax: 410-614-3676<BR>
<BR>
<BR>
On 4/8/10 12:20 PM, &quot;joanne powell&quot; &lt;<a href="joanne.powell@hotmail.com">joanne.powell@hotmail.com</a>&gt; wrote:<BR>
<BR>
</SPAN></FONT><BLOCKQUOTE><FONT SIZE="2"><FONT FACE="Verdana, Helvetica, Arial"><SPAN STYLE='font-size:10pt'>Hi <BR>
&nbsp;<BR>
Is there a way for DTI studio to read .hdr .img files. <BR>
I would like to perform motion correction on the images before performing tractography and have used FSL to do this (as I do not know any other way).<BR>
The file comes out as a .hdr .img file and I am unsure how to open these images in DTI studio to perform tractography.<BR>
&nbsp;<BR>
Would anybody kindly be able to offer me any help or advice here?<BR>
&nbsp;<BR>
Kindest regards<BR>
Joanne<BR>
&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;<BR>
<HR ALIGN=CENTER SIZE="3" WIDTH="100%">Get a free e-mail account with Hotmail. Sign-up now. <BR>
<HR ALIGN=CENTER SIZE="3" WIDTH="95%"></SPAN></FONT><SPAN STYLE='font-size:10pt'><FONT FACE="Consolas, Courier New, Courier">_______________________________________________<BR>
Mristudio-users mailing list<BR>
<a href="Mristudio-users@mristudio.org">Mristudio-users@mristudio.org</a><BR>
<a href="http://lists.mristudio.org/mailman/listinfo/">http://lists.mristudio.org/mailman/listinfo/</a><BR>
Unsubscribe, send a blank email to: <a href="Mristudio-users-unsubscribe@mristudio.org">Mristudio-users-unsubscribe@mristudio.org</a><BR>
</FONT></SPAN></FONT></BLOCKQUOTE>
</BODY>
</HTML>