<div>Dear DTIStudio users,</div>
<div> </div>
<div>I am interested in investigating the cingulum bundle but am having trouble fibertracking the cingulum bundle.</div>
<div> </div>
<div>Based on the ColorMap0 and Eigenvector0 values in the region of the dorsal cingulum bundle, I would expect fibertracking to occur in an anterior-posterior manner but it is not the case. </div>
<div> </div>
<div>1-ColorMap0.jpeg shows the ColorMap0. At the cingulum bundle region, the 2nd value is the greatest among the 3. (eg: 19,126,27 or 6,136,40)</div>
<div> </div>
<div>2-Evector0.jpeg shows the Eigenvector0. At the cingulum bundle region, the 2nd value is the greatest among the 3. (eg: -0.21,0.95,-0.20)</div>
<div> </div>
<div>3-fibertrack.jpeg is obtained by fibertracking using the binary image of the left cingulum mask from WMPMII </div>
<div>The threshold criteria is restrictive so that not too many fibers obstruct the visualisation of the cingulum (threshold criteria is 0.3 for minimum FA and angle of 50degrees). The resulting fibertrack is still unexpected because it does not traverse in anterior-posterior manner but in the dorsal-ventral manner. </div>


<div> </div>
<div>Fibertracking at 0.15 minimum FA and angle of 70degrees. results in 4-fibertrack.jpeg. I further select the cingulum bundles by using the ROI AND operation at different coronal slices.</div>
<div> </div>
<div>At coronal slice 101, I am still able to obtain reasonable fibertrack results. 5-fibertrack.jpeg, the fibertracks lie in the cingulum region that is expected and extends over around14-18 slices from 101 to 114.</div>


<div> </div>
<div>However, as I try to delineate the cingulum bundle at more anterior coronal slices the cingulum is more horizontal, the fibertracking result delineates in dorsal-ventral manner. In the 6-fibertrack.jpeg, the fibertracks obtained extend over only 7 slices. </div>
<div><br></div><div>I do not understand how this is so because the ColorMap0 and the Eigenvector0 seem to indicate that the principle diffusion direction is indeed in the anterior-posterior direction.</div>

<div><br></div><div>-----------</div>
<div>Some other information</div>
<div>The image I used is a group registered to the JHU-MNI atlas. The images are averaged across many subjects to increase signal to noise ratio. However, when i repeat fibertracking on single subjects, the fibertracking results are still more dorsal-ventral than anterior-posterior. </div>

<div>------------</div><div><br></div><div>Pls offer any suggestions. I really need the help. I can offer more additional information on my problem if required.</div><div><br></div><div>Thank you in advance. I would really appreciate it.</div>

<div>Regards,</div>
<div>Farid</div>