Hi Susumu,<br>
<br>
Thanks for the help. I tried as you told and its working now.<br><br>regards,<br>Manoj<br><br><div class="gmail_quote">On Fri, Dec 4, 2009 at 8:25 AM, susumu mori <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:susumu@mri.jhu.edu">susumu@mri.jhu.edu</a>&gt;</span> wrote:<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="border-left: 1px solid rgb(204, 204, 204); margin: 0pt 0pt 0pt 0.8ex; padding-left: 1ex;">Hi Manoj,<br><br>Please test the following. I also experienced some similar issues some time ago and I though this issue was solved since then, but may be still there.<br>
The issue is, DtiStudio remembers parameters in the previous session. When you choose &quot;all slice&quot;, it may still take the slice number of the previous session.<br>
<br>&gt;In the opening data input window, choose &quot;partial slice&quot; and specify 0 - 75. <br>&gt;Load the data and close the DtiStudio.<br>&gt;Load the same data with &quot;all slice&quot; and close the window<br><br>

This may refresh the memory.<br><br>Also please try the latest version posted in MriStudio.org.<br><br>If nothing works, we&#39;ll look into the data.<br><font color="#888888"><br>Susumu</font><div><div></div><div class="h5">
<br><br><div class="gmail_quote">On Thu, Dec 3, 2009 at 11:05 PM, manoj sarma <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:mksarma@gmail.com" target="_blank">mksarma@gmail.com</a>&gt;</span> wrote:<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="border-left: 1px solid rgb(204, 204, 204); margin: 0pt 0pt 0pt 0.8ex; padding-left: 1ex;">Hi Susumu,<br><br>Thanks for your prompt reply. I have already chosen  &quot;all slice&quot; in the data input window and that&#39;s why I am confused. When I process the raw data, there is no problem. I am facing problem when I try to use &quot;DTI map &quot; function to generate FA, MD map etc. <br>


<br>regards,<br><font color="#888888">Manoj</font><div><div></div><div><br><br><br><br><div class="gmail_quote">On Thu, Dec 3, 2009 at 6:57 PM, susumu mori <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:susumu@mri.jhu.edu" target="_blank">susumu@mri.jhu.edu</a>&gt;</span> wrote:<br>

<blockquote class="gmail_quote" style="border-left: 1px solid rgb(204, 204, 204); margin: 0pt 0pt 0pt 0.8ex; padding-left: 1ex;">
Hi Manoj,<br><br>Please make sure that you chose &quot;all slice&quot; in the data input window in the beginning. There is a function to restrict the number of slices to process in case you run into memory shortage.<br><br>



Susumu<br><br><div class="gmail_quote"><div><div></div><div>On Thu, Dec 3, 2009 at 6:57 PM, manoj sarma <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:mksarma@gmail.com" target="_blank">mksarma@gmail.com</a>&gt;</span> wrote:<br>
</div></div><blockquote class="gmail_quote" style="border-left: 1px solid rgb(204, 204, 204); margin: 0pt 0pt 0pt 0.8ex; padding-left: 1ex;"><div><div></div><div>
Hi,<br><br>I am new to DTI-Studio. I am facing a problem regarding number of slices produced after I generate DTI-map. My raw DTI data have 76 slices and after processing with DTI-Studio I get the same. But when I generate DTI map it produces 50 slices only. I am confused where is the problem. How can I have same number of slices generate as the raw data?<br>




<br><br>regards,<br><font color="#888888">Manoj<br>
</font><br></div></div>_______________________________________________<br>
Mristudio-users mailing list<br>
<a href="mailto:Mristudio-users@mristudio.org" target="_blank">Mristudio-users@mristudio.org</a><br>
<a href="http://lists.mristudio.org/mailman/listinfo/" target="_blank">http://lists.mristudio.org/mailman/listinfo/</a><br>
Unsubscribe, send a blank email to: <a href="mailto:Mristudio-users-unsubscribe@mristudio.org" target="_blank">Mristudio-users-unsubscribe@mristudio.org</a><br>
<br></blockquote></div><br>
<br>_______________________________________________<br>
Mristudio-users mailing list<br>
<a href="mailto:Mristudio-users@mristudio.org" target="_blank">Mristudio-users@mristudio.org</a><br>
<a href="http://lists.mristudio.org/mailman/listinfo/" target="_blank">http://lists.mristudio.org/mailman/listinfo/</a><br>
Unsubscribe, send a blank email to: <a href="mailto:Mristudio-users-unsubscribe@mristudio.org" target="_blank">Mristudio-users-unsubscribe@mristudio.org</a><br>
<br></blockquote></div><br>
</div></div><br>_______________________________________________<br>
Mristudio-users mailing list<br>
<a href="mailto:Mristudio-users@mristudio.org" target="_blank">Mristudio-users@mristudio.org</a><br>
<a href="http://lists.mristudio.org/mailman/listinfo/" target="_blank">http://lists.mristudio.org/mailman/listinfo/</a><br>
Unsubscribe, send a blank email to: <a href="mailto:Mristudio-users-unsubscribe@mristudio.org" target="_blank">Mristudio-users-unsubscribe@mristudio.org</a><br>
<br></blockquote></div><br>
</div></div><br>_______________________________________________<br>
Mristudio-users mailing list<br>
<a href="mailto:Mristudio-users@mristudio.org">Mristudio-users@mristudio.org</a><br>
<a href="http://lists.mristudio.org/mailman/listinfo/" target="_blank">http://lists.mristudio.org/mailman/listinfo/</a><br>
Unsubscribe, send a blank email to: <a href="mailto:Mristudio-users-unsubscribe@mristudio.org">Mristudio-users-unsubscribe@mristudio.org</a><br>
<br></blockquote></div><br>