<html><head><style type="text/css"><!-- DIV {margin:0px;} --></style></head><body><div style="font-family:times new roman,new york,times,serif;font-size:12pt"><div>*.ani is the updated_FA file <br>and *.vec is the updated eigenvector0 file.<br>I think the format for both is *.dat .. just different extensions to differentiate I guess ..<br></div><div style="font-family: times new roman,new york,times,serif; font-size: 12pt;"><br><div style="font-family: times new roman,new york,times,serif; font-size: 12pt;"><font size="2" face="Tahoma"><hr size="1"><b><span style="font-weight: bold;">From:</span></b> [Seongjin] &lt;choisj70@gmail.com&gt;<br><b><span style="font-weight: bold;">To:</span></b> "DTI Studio, ROI Editor, Landmarker Questions/Support" &lt;mristudio-users@mristudio.org&gt;<br><b><span style="font-weight: bold;">Sent:</span></b> Friday, May 1, 2009 12:01:05 PM<br><b><span style="font-weight: bold;">Subject:</span></b> [Mristudio-users] Questions
 regarding Transformation in Landmark<br></font><br>
I have data sets having reduced field of view compared to template in the Landmarker.<br>I simply used linear AIR for space normalization.<br><br>Translation and non-linear AIR seems not available for data of different dimensions from the template.<br>
<br><br>Q1. I wonder what other restrictions in the space normalization or transformation by using Landmarker.<br><br>Q2. After transformation, I would like to do fiber tracking in DTI Studio. What steps should I go through?<br>
&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; I tried to use "Fiber Tracking" in DTI Studio main menu, however it asked to load "*.ani" file and "*.vec" file.<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; Those files were not generated at all from the normalization.<br>
&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; I have updated FA, eigenvalue, tensor and AlignlinearOuptut.air. <br><br>Thanks in advance.<br><br>-SC<br><br>
</div></div></div><br>

      </body></html>