<html xmlns:v="urn:schemas-microsoft-com:vml" xmlns:o="urn:schemas-microsoft-com:office:office" xmlns:w="urn:schemas-microsoft-com:office:word" xmlns="http://www.w3.org/TR/REC-html40">

<head>
<META HTTP-EQUIV="Content-Type" CONTENT="text/html; charset=us-ascii">
<meta name=Generator content="Microsoft Word 11 (filtered medium)">
<!--[if !mso]>
<style>
v\:* {behavior:url(#default#VML);}
o\:* {behavior:url(#default#VML);}
w\:* {behavior:url(#default#VML);}
.shape {behavior:url(#default#VML);}
</style>
<![endif]-->
<style>
<!--
 /* Font Definitions */
 @font-face
        {font-family:"MS Mincho";
        panose-1:2 2 6 9 4 2 5 8 3 4;}
@font-face
        {font-family:SimSun;
        panose-1:2 1 6 0 3 1 1 1 1 1;}
@font-face
        {font-family:Tahoma;
        panose-1:2 11 6 4 3 5 4 4 2 4;}
@font-face
        {font-family:"\@MS Mincho";
        panose-1:2 2 6 9 4 2 5 8 3 4;}
@font-face
        {font-family:"MS PGothic";
        panose-1:2 11 6 0 7 2 5 8 2 4;}
@font-face
        {font-family:"\@MS PGothic";
        panose-1:2 11 6 0 7 2 5 8 2 4;}
@font-face
        {font-family:"\@SimSun";
        panose-1:2 1 6 0 3 1 1 1 1 1;}
 /* Style Definitions */
 p.MsoNormal, li.MsoNormal, div.MsoNormal
        {margin:0in;
        margin-bottom:.0001pt;
        font-size:12.0pt;
        font-family:SimSun;}
a:link, span.MsoHyperlink
        {color:blue;
        text-decoration:underline;}
a:visited, span.MsoHyperlinkFollowed
        {color:purple;
        text-decoration:underline;}
p
        {mso-margin-top-alt:auto;
        margin-right:0in;
        mso-margin-bottom-alt:auto;
        margin-left:0in;
        font-size:12.0pt;
        font-family:"MS PGothic";}
span.EmailStyle17
        {mso-style-type:personal;
        font-family:Arial;
        color:navy;}
span.EmailStyle19
        {mso-style-type:personal-reply;
        font-family:Arial;
        color:navy;}
@page Section1
        {size:8.5in 11.0in;
        margin:1.0in 1.25in 1.0in 1.25in;}
div.Section1
        {page:Section1;}
-->
</style>
<!--[if gte mso 9]><xml>
 <o:shapedefaults v:ext="edit" spidmax="1026" />
</xml><![endif]--><!--[if gte mso 9]><xml>
 <o:shapelayout v:ext="edit">
  <o:idmap v:ext="edit" data="1" />
 </o:shapelayout></xml><![endif]-->
</head>

<body lang=EN-US link=blue vlink=purple>

<div class=Section1>

<p class=MsoNormal><font size=2 color=navy face=Arial><span style='font-size:
10.0pt;font-family:Arial;color:navy'>did you use AIR-based or LDDMM-based
normlization?<o:p></o:p></span></font></p>

<p class=MsoNormal><font size=2 color=navy face=Arial><span style='font-size:
10.0pt;font-family:Arial;color:navy'><o:p>&nbsp;</o:p></span></font></p>

<p class=MsoNormal><font size=2 color=navy face=Arial><span style='font-size:
10.0pt;font-family:Arial;color:navy'><o:p>&nbsp;</o:p></span></font></p>

<div>

<div class=MsoNormal align=center style='text-align:center'><font size=3
face="MS PGothic"><span style='font-size:12.0pt;font-family:"MS PGothic"'>

<hr size=2 width="100%" align=center tabindex=-1>

</span></font></div>

<p class=MsoNormal><b><font size=2 face=Tahoma><span style='font-size:10.0pt;
font-family:Tahoma;font-weight:bold'>From:</span></font></b><font size=2
face=Tahoma><span style='font-size:10.0pt;font-family:Tahoma'>
mristudio-users-bounces@mristudio.org
[mailto:mristudio-users-bounces@mristudio.org] <b><span style='font-weight:
bold'>On Behalf Of </span></b>Wang, Sumei<br>
<b><span style='font-weight:bold'>Sent:</span></b> Monday, November 10, 2008 9:18
AM<br>
<b><span style='font-weight:bold'>To:</span></b> DTI Studio, ROI
Editor,Landmarker Questions/Support<br>
<b><span style='font-weight:bold'>Subject:</span></b> [Mristudio-users]
Normalized Fibers</span></font><font face="MS PGothic"><span style='font-family:
"MS PGothic"'><o:p></o:p></span></font></p>

</div>

<p class=MsoNormal><font size=3 face=SimSun><span style='font-size:12.0pt'><o:p>&nbsp;</o:p></span></font></p>

<div>

<p><font size=2 face=Arial><span style='font-size:10.0pt;font-family:Arial'>Dear
all,</span></font><o:p></o:p></p>

<p><font size=2 face=Arial><span style='font-size:10.0pt;font-family:Arial'>I
am working on the brain tumor project. I applied linear and non-linear
normalization process using the template provided by landmarker. The result
looks good.&nbsp;The brain was well aligned. &nbsp;I saved the transformation
matrix and used it to the generated fibers (corticospinal tract). However, the
fiber become very thin and the location was a little bit shifted&nbsp;after the
normalization process.&nbsp;Does anybody have such kind of problem?</span></font><o:p></o:p></p>

<p><font size=2 face=Arial><span style='font-size:10.0pt;font-family:Arial'>Thank
you very much for the help.</span></font><o:p></o:p></p>

<p><font size=2 face=Arial><span style='font-size:10.0pt;font-family:Arial'>Best
wishes</span></font><o:p></o:p></p>

<p><font size=2 face=Arial><span style='font-size:10.0pt;font-family:Arial'>Sumei</span></font><o:p></o:p></p>

</div>

<blockquote style='margin-top:5.0pt;margin-right:0in;margin-bottom:5.0pt'>

<p class=MsoNormal><font size=3 face="MS PGothic"><span style='font-size:12.0pt;
font-family:"MS PGothic"'>&nbsp;<o:p></o:p></span></font></p>

</blockquote>

</div>

</body>

</html>
<BR>
The information contained in this e-mail message is intended only for the personal and confidential use of the recipient(s) named above. If the reader of this message is not the intended recipient or an agent responsible for delivering it to the intended recipient, you are hereby notified that you have received this document in error and that any review, dissemination, distribution, or copying of this message is strictly prohibited. If you have received this communication in error, please notify us immediately by e-mail, and delete the original message.