<br><font size=2 face="sans-serif">Please remove me from your mailing list.</font>
<br>
<br>
<br>
<br>
<table width=100%>
<tr valign=top>
<td width=40%><font size=1 face="sans-serif"><b>XIN LI &lt;xli16@jhmi.edu&gt;</b>
</font>
<br><font size=1 face="sans-serif">Sent by: mristudio-users-bounces@mristudio.org</font>
<p><font size=1 face="sans-serif">09/10/2008 05:46 PM</font>
<table border>
<tr valign=top>
<td bgcolor=white>
<div align=center><font size=1 face="sans-serif">Please respond to<br>
&quot;DTI Studio, ROI Editor, &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;Landmarker
Questions/Support&quot; &lt;mristudio-users@mristudio.org&gt;</font></div></table>
<br>
<td width=59%>
<table width=100%>
<tr valign=top>
<td>
<div align=right><font size=1 face="sans-serif">To</font></div>
<td><font size=1 face="sans-serif">&quot;DTI Studio, ROI Editor, &nbsp;
&nbsp; &nbsp; &nbsp;Landmarker Questions/Support&quot; &lt;mristudio-users@mristudio.org&gt;</font>
<tr valign=top>
<td>
<div align=right><font size=1 face="sans-serif">cc</font></div>
<td>
<tr valign=top>
<td>
<div align=right><font size=1 face="sans-serif">Subject</font></div>
<td><font size=1 face="sans-serif">Re: [Mristudio-users] ROI uploading
and viewing in DTI Studio</font></table>
<br>
<table>
<tr valign=top>
<td>
<td></table>
<br></table>
<br>
<br>
<br><tt><font size=2>Elizabeth,<br>
<br>
Please try the following:<br>
<br>
1. Set the operation of the first fiber as &quot;0&quot; not &quot;1&quot;.<br>
<br>
2. Add one more line for each fiber: ColorMode: &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;
&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; 0<br>
<br>
<br>
Xin<br>
<br>
<br>
<br>
----- Original Message -----<br>
From: Elizabeth Finger &lt;Elizabeth.Finger@lhsc.on.ca&gt;<br>
Date: Wednesday, September 10, 2008 3:00 pm<br>
Subject: Re: [Mristudio-users] ROI uploading and viewing in DTI Studio<br>
To: mristudio-users@mristudio.org<br>
<br>
<br>
&gt; Thanks - I have tried that as well but still have the same problem.<br>
&gt; &nbsp;<br>
&gt; &nbsp;Elizabeth<br>
&gt; &nbsp;<br>
&gt; &nbsp;&gt;&gt;&gt; XIN LI &lt;xli16@jhmi.edu&gt; 09/10/08 2:45 PM
&gt;&gt;&gt;<br>
&gt; &nbsp;Elizabeth,<br>
&gt; &nbsp;<br>
&gt; &nbsp;Please change the file name from &quot;ROIMap_motor_map.dat&quot;
to <br>
&gt; &quot;ROIMap_motor_map.map&quot; and try again.<br>
&gt; &nbsp;<br>
&gt; &nbsp;Xin<br>
&gt; &nbsp;<br>
&gt; &nbsp;<br>
&gt; &nbsp;<br>
&gt; &nbsp;----- Original Message -----<br>
&gt; &nbsp;From: Elizabeth Finger &lt;Elizabeth.Finger@lhsc.on.ca&gt;<br>
&gt; &nbsp;Date: Wednesday, September 10, 2008 2:13 pm<br>
&gt; &nbsp;Subject: [Mristudio-users] ROI uploading and viewing in DTI
Studio<br>
&gt; &nbsp;To: mristudio-users@mristudio.org<br>
&gt; &nbsp;<br>
&gt; &nbsp;<br>
&gt; &nbsp;&gt; Hello-<br>
&gt; &nbsp;&gt; &nbsp;<br>
&gt; &nbsp;&gt; &nbsp;I have been following the proior posts on this topic
but cannot <br>
&gt; seem <br>
&gt; &nbsp;&gt; to open up &nbsp;in DTI studio the ROI's saved as a binary
map which I <br>
&gt; &nbsp;&gt; created in ROI Editor. &nbsp;I have attached the binary
map file that I <br>
&gt; <br>
&gt; &nbsp;&gt; created in ROI Editor and then edited to include the Operation:
1 <br>
&gt; to <br>
&gt; &nbsp;&gt; each binary file to signify AND. &nbsp;Then in DTI-Studio-
<br>
&gt; Fibertracking, I <br>
&gt; &nbsp;&gt; load my FA map and eigenvector_0 and complete the fiber
tracking. &nbsp;<br>
&gt; <br>
&gt; &nbsp;&gt; When I then in the fiber tab under ROI Operation click
on load, <br>
&gt; binary <br>
&gt; &nbsp;&gt; map, and select my file, nothing (no ROIs nor fibers) appear
on the <br>
&gt; <br>
&gt; &nbsp;&gt; screen, and no ROI statistics are available. &nbsp;I have
tried this <br>
&gt; with <br>
&gt; &nbsp;&gt; several subjects and with several different ROIs. &nbsp;Perhaps
there is <br>
&gt; a <br>
&gt; &nbsp;&gt; step I have missed?<br>
&gt; &nbsp;&gt; &nbsp;<br>
&gt; &nbsp;&gt; &nbsp;Thank you,<br>
&gt; &nbsp;&gt; &nbsp;Elizabeth Finger <br>
&gt; &nbsp;&gt; &nbsp; --------------------------------------------------------------------------------<br>
&gt; &nbsp;&gt; &nbsp;This information is directed in confidence solely
to the person <br>
&gt; named <br>
&gt; &nbsp;&gt; above and may contain confidential and/or privileged material.
This <br>
&gt; <br>
&gt; &nbsp;&gt; information may not otherwise be distributed, copied or
disclosed. <br>
&gt; If <br>
&gt; &nbsp;&gt; you have received this e-mail in error, please notify the
sender <br>
&gt; &nbsp;&gt; immediately via a return e-mail and destroy original message.
Thank <br>
&gt; <br>
&gt; &nbsp;&gt; you for your cooperation. <br>
&gt; &nbsp;&gt; _______________________________________________<br>
&gt; &nbsp;&gt; &nbsp;Mristudio-users mailing list<br>
&gt; &nbsp;&gt; &nbsp;Mristudio-users@mristudio.org<br>
&gt; &nbsp;&gt; &nbsp; <br>
&gt; &nbsp;_______________________________________________<br>
&gt; &nbsp;Mristudio-users mailing list<br>
&gt; &nbsp;Mristudio-users@mristudio.org<br>
&gt; &nbsp;<br>
&gt; &nbsp;<br>
&gt; &nbsp; --------------------------------------------------------------------------------<br>
&gt; &nbsp;This information is directed in confidence solely to the person
named <br>
&gt; above and may contain confidential and/or privileged material. This
<br>
&gt; information may not otherwise be distributed, copied or disclosed.
If <br>
&gt; you have received this e-mail in error, please notify the sender <br>
&gt; immediately via a return e-mail and destroy original message. Thank
<br>
&gt; you for your cooperation.<br>
&gt; &nbsp;<br>
&gt; &nbsp;_______________________________________________<br>
&gt; &nbsp;Mristudio-users mailing list<br>
&gt; &nbsp;Mristudio-users@mristudio.org<br>
&gt; &nbsp; <br>
_______________________________________________<br>
Mristudio-users mailing list<br>
Mristudio-users@mristudio.org<br>
</font></tt><a href="http://lists.mristudio.org/mailman/listinfo/mristudio-users"><tt><font size=2>http://lists.mristudio.org/mailman/listinfo/mristudio-users<br>
</font></tt></a>
<br>