<html xmlns:v="urn:schemas-microsoft-com:vml" xmlns:o="urn:schemas-microsoft-com:office:office" xmlns:w="urn:schemas-microsoft-com:office:word" xmlns="http://www.w3.org/TR/REC-html40">

<head>
<META HTTP-EQUIV="Content-Type" CONTENT="text/html; charset=us-ascii">
<meta name=Generator content="Microsoft Word 11 (filtered medium)">
<!--[if !mso]>
<style>
v\:* {behavior:url(#default#VML);}
o\:* {behavior:url(#default#VML);}
w\:* {behavior:url(#default#VML);}
.shape {behavior:url(#default#VML);}
</style>
<![endif]-->
<style>
<!--
 /* Font Definitions */
 @font-face
        {font-family:"MS Mincho";
        panose-1:2 2 6 9 4 2 5 8 3 4;}
@font-face
        {font-family:Tahoma;
        panose-1:2 11 6 4 3 5 4 4 2 4;}
@font-face
        {font-family:"\@MS Mincho";
        panose-1:2 2 6 9 4 2 5 8 3 4;}
 /* Style Definitions */
 p.MsoNormal, li.MsoNormal, div.MsoNormal
        {margin:0in;
        margin-bottom:.0001pt;
        font-size:12.0pt;
        font-family:"Times New Roman";}
a:link, span.MsoHyperlink
        {color:blue;
        text-decoration:underline;}
a:visited, span.MsoHyperlinkFollowed
        {color:purple;
        text-decoration:underline;}
span.EmailStyle17
        {mso-style-type:personal-reply;
        font-family:Arial;
        color:navy;}
@page Section1
        {size:8.5in 11.0in;
        margin:1.0in 1.25in 1.0in 1.25in;}
div.Section1
        {page:Section1;}
-->
</style>

</head>

<body lang=EN-US link=blue vlink=purple>

<div class=Section1>

<p class=MsoNormal><font size=2 color=navy face=Arial><span style='font-size:
10.0pt;font-family:Arial;color:navy'>I don't think DtiStudio can read NIfTI,
but we can look into it.<o:p></o:p></span></font></p>

<p class=MsoNormal><font size=2 color=navy face=Arial><span style='font-size:
10.0pt;font-family:Arial;color:navy'>If NIfTI is simply a header + data format
and you know the exact size of the header, you can try &quot;image offset&quot;
+ raw or REC format. Once you could load it to MriView, you can convert the
data to REC format (assuming you have 4D file), which can be used for tensor
calculation (DtiMapping).<o:p></o:p></span></font></p>

<p class=MsoNormal><font size=2 color=navy face=Arial><span style='font-size:
10.0pt;font-family:Arial;color:navy'><o:p>&nbsp;</o:p></span></font></p>

<p class=MsoNormal><font size=2 color=navy face=Arial><span style='font-size:
10.0pt;font-family:Arial;color:navy'><o:p>&nbsp;</o:p></span></font></p>

<div>

<div class=MsoNormal align=center style='text-align:center'><font size=3
face="Times New Roman"><span style='font-size:12.0pt'>

<hr size=2 width="100%" align=center tabindex=-1>

</span></font></div>

<p class=MsoNormal><b><font size=2 face=Tahoma><span style='font-size:10.0pt;
font-family:Tahoma;font-weight:bold'>From:</span></font></b><font size=2
face=Tahoma><span style='font-size:10.0pt;font-family:Tahoma'> mristudio-users-bounces@mristudio.org
[mailto:mristudio-users-bounces@mristudio.org] <b><span style='font-weight:
bold'>On Behalf Of </span></b>Raj Jaswal<br>
<b><span style='font-weight:bold'>Sent:</span></b> Sunday, July 13, 2008 10:00
PM<br>
<b><span style='font-weight:bold'>To:</span></b> mristudio-users@mristudio.org<br>
<b><span style='font-weight:bold'>Subject:</span></b> [Mristudio-users] Loading
NIfTI (.nii) format</span></font><o:p></o:p></p>

</div>

<p class=MsoNormal><font size=3 face="Times New Roman"><span style='font-size:
12.0pt'><o:p>&nbsp;</o:p></span></font></p>

<p class=MsoNormal><font size=3 face="Times New Roman"><span style='font-size:
12.0pt'>Hello all,<br>
<br>
&nbsp; I'm having some problems loading the NIfTI (.nii) format using DTI
Studio.<br>
<br>
&nbsp; First, when I decide to load a .nii file through MRI View3D...I do not
find the appropriate format to select in the &quot;Image Parameters&quot;
window. I tried to select the Analyze format because the .nii format is adapted
from the Analyze format. But that does not work. I get the following error:<br>
<b><span style='font-weight:bold'>&nbsp;<br>
&nbsp; CMriView3DDoc()::CreateImgWithAnalyzeFile()<br>
&nbsp; Analyze Header File open error:</span></b><br>
<br>
&nbsp; Next, if I want to load a .nii file through DTI Mapping...I do not find
the appropriate format to select.<br>
<br>
&nbsp; The dataset that I have consists of one .nii file and one header file
per subject.<br>
<br>
&nbsp; I am still relatively new to DTI Studio and am learning a lot as I go
along! I would appreciate any help or input. Thank you very much.<br clear=all>
<br>
-- <br>
- RJ <o:p></o:p></span></font></p>

</div>

</body>

</html>