<!DOCTYPE HTML PUBLIC "-//W3C//DTD HTML 4.0 Transitional//EN">
<HTML xmlns:o = "urn:schemas-microsoft-com:office:office"><HEAD>
<META http-equiv=Content-Type content="text/html; charset=iso-2022-jp">
<META content="MSHTML 6.00.2900.3354" name=GENERATOR>
<STYLE></STYLE>
</HEAD>
<BODY bgColor=#ffffff>
<DIV><FONT size=2><SPAN lang=EN-US><FONT face="MS UI Gothic" 
size=3>Hello</FONT></SPAN></DIV>
<DIV>
<P class=MsoNormal style="MARGIN: 0mm 0mm 0pt"><SPAN lang=EN-US><FONT 
face="MS UI Gothic" size=3></FONT></SPAN>&nbsp;</P>
<P class=MsoNormal style="MARGIN: 0mm 0mm 0pt"><SPAN lang=EN-US><FONT 
face="MS UI Gothic" size=3>I have two scans of DWI with time interval for each 
patient (1st scan and 2nd scan). </FONT></SPAN><SPAN lang=EN-US><FONT 
face="MS UI Gothic" size=3>I would like to coregister the&nbsp;images in the 2nd 
scan&nbsp;onto&nbsp;those in the&nbsp;1st&nbsp;scan in each subject using 
Automatic Image Registration (AIR) algorithm implemented in DTIStudio, for the 
purpose of drawing ROIs in the same brain regions in both 
scans.</FONT></SPAN></P>
<P class=MsoNormal style="MARGIN: 0mm 0mm 0pt"><SPAN lang=EN-US><o:p><FONT 
face="MS UI Gothic" size=3>&nbsp;</FONT></o:p></SPAN></P>
<P class=MsoNormal style="MARGIN: 0mm 0mm 0pt"><SPAN lang=EN-US><FONT 
face="MS UI Gothic" size=3>First, I&nbsp;did eddy current correction and motion 
correction using affine transformation in each scan (1st scan and 2nd 
scan).</FONT></SPAN></P>
<P class=MsoNormal style="MARGIN: 0mm 0mm 0pt"><SPAN lang=EN-US><FONT 
face="MS UI Gothic" size=3>Then, I coregistered&nbsp;the B0 image&nbsp;in the 
2nd scan&nbsp;onto that&nbsp;in the&nbsp;1st scan. </FONT></SPAN><SPAN 
lang=EN-US><FONT face="MS UI Gothic" size=3>And I would like to adjust the same 
transformation matrix to the rest of the&nbsp;images in the 2nd 
scan.</FONT></SPAN></P>
<P class=MsoNormal style="MARGIN: 0mm 0mm 0pt"><SPAN lang=EN-US><o:p><FONT 
face="MS UI Gothic" size=3>&nbsp;</FONT></o:p></SPAN></P>
<P class=MsoNormal style="MARGIN: 0mm 0mm 0pt"><SPAN lang=EN-US><FONT 
face="MS UI Gothic" size=3>I know that the transformation matrix can be saved 
when conducting AIR. </FONT></SPAN><SPAN lang=EN-US><FONT face="MS UI Gothic" 
size=3>Can we use this file to transform the rest of the images in the 2nd 
scan?</FONT></SPAN></P>
<P class=MsoNormal style="MARGIN: 0mm 0mm 0pt"><SPAN lang=EN-US><o:p><FONT 
face="MS UI Gothic" size=3>&nbsp;</FONT></o:p></SPAN></P>
<P class=MsoNormal style="MARGIN: 0mm 0mm 0pt"><SPAN lang=EN-US><FONT 
face="MS UI Gothic" size=3>Many thanks,</FONT></SPAN></P>
<P class=MsoNormal style="MARGIN: 0mm 0mm 0pt"><SPAN lang=EN-US><FONT 
face="MS UI Gothic" size=3></FONT></SPAN>&nbsp;</P>
<P class=MsoNormal style="MARGIN: 0mm 0mm 0pt"><SPAN lang=EN-US><FONT 
face="MS UI Gothic" size=3>Shigetoshi 
Takaya</FONT></SPAN></P></FONT></DIV></BODY></HTML>