Hello,<br><br>At the Toronto workshop, it was mentioned that loading analyze format images into dtistudio is not recommended as the images are loaded in flipped, and so the gradient tables will not apply properly, as I understood. <br>
<br>We have analyzed a couple of subjects from two separate datasets using both the raw dicoms in dtistudio (following AIR), but also with some analyze format images that have been preprocessed in FSL (eddy-current correction). <br>
<br>Surprisingly, the FA maps and colour maps are qualitatively very similar between the two methods, which is counterintuitive given the improper mapping between the gradient table and orientation of the analyze imgs. Also, the FA values are generally <i>higher</i> by 0.2 or so in the analyze version of the analysis. Is it possible that the analyze format is actually being read properly though its display is wrong? Any thoughts on the validity of using analyze format would be appreciated.<br>
<br>Thanks,<br>Graeme<br><br><br clear="all"><br>-- <br>Graeme C. Schwindt, HBSc<br>MD/PhD Student<br>University of Toronto<br><a href="mailto:graeme.schwindt@gmail.com">graeme.schwindt@gmail.com</a><br>416.546.5453