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<div class=Section1>

<p class=MsoNormal><font size=2 color=navy face=Arial><span style='font-size:
10.0pt;font-family:Arial;color:navy'>Hi Barbara,<o:p></o:p></span></font></p>

<p class=MsoNormal><font size=2 color=navy face=Arial><span style='font-size:
10.0pt;font-family:Arial;color:navy'><o:p>&nbsp;</o:p></span></font></p>

<p class=MsoNormal><font size=2 color=navy face=Arial><span style='font-size:
10.0pt;font-family:Arial;color:navy'>I see. Unfortunately, DtiStudio doesn't
have very strong support for the image superimposition....<o:p></o:p></span></font></p>

<p class=MsoNormal><font size=2 color=navy face=Arial><span style='font-size:
10.0pt;font-family:Arial;color:navy'><o:p>&nbsp;</o:p></span></font></p>

<p class=MsoNormal><font size=2 color=navy face=Arial><span style='font-size:
10.0pt;font-family:Arial;color:navy'><o:p>&nbsp;</o:p></span></font></p>

<div>

<div class=MsoNormal align=center style='text-align:center'><font size=3
face="Times New Roman"><span style='font-size:12.0pt'>

<hr size=2 width="100%" align=center tabindex=-1>

</span></font></div>

<p class=MsoNormal><b><font size=2 face=Tahoma><span style='font-size:10.0pt;
font-family:Tahoma;font-weight:bold'>From:</span></font></b><font size=2
face=Tahoma><span style='font-size:10.0pt;font-family:Tahoma'>
mristudio-users-bounces@mristudio.org
[mailto:mristudio-users-bounces@mristudio.org] <b><span style='font-weight:
bold'>On Behalf Of </span></b>Barbara Weiland<br>
<b><span style='font-weight:bold'>Sent:</span></b> Saturday, April 19, 2008
4:20 PM<br>
<b><span style='font-weight:bold'>To:</span></b> DTI Studio, ROI Editor,
Landmarker Questions/Support<br>
<b><span style='font-weight:bold'>Subject:</span></b> Re: [Mristudio-users]
functional overlays</span></font><o:p></o:p></p>

</div>

<p class=MsoNormal><font size=3 face="Times New Roman"><span style='font-size:
12.0pt'><o:p>&nbsp;</o:p></span></font></p>

<p class=MsoNormal style='margin-bottom:12.0pt'><font size=3
face="Times New Roman"><span style='font-size:12.0pt'>The answer is a bit of
both - I have corregistered by MEG data to the 3d volumetric MRI which was
corregistered to the B0 set of DTI scan.&nbsp; So I can move ROIs between these
sets but I would like to be able to see them all together.&nbsp; <br>
<br>
Thanks,<br>
Barbara<o:p></o:p></span></font></p>

<div>

<p class=MsoNormal><font size=3 face="Times New Roman"><span style='font-size:
12.0pt'>On Sat, Apr 19, 2008 at 2:51 PM, susumu &lt;<a
href="mailto:susumu@mri.jhu.edu">susumu@mri.jhu.edu</a>&gt; wrote:<o:p></o:p></span></font></p>

<div bgcolor="#ffffff">

<div>

<p class=MsoNormal><font size=2 face=Arial><span style='font-size:10.0pt;
font-family:Arial'>Hi Barbara,</span></font><o:p></o:p></p>

</div>

<div>

<p class=MsoNormal><font size=3 face="Times New Roman"><span style='font-size:
12.0pt'>&nbsp;<o:p></o:p></span></font></p>

</div>

<div>

<p class=MsoNormal><font size=2 face=Arial><span style='font-size:10.0pt;
font-family:Arial'>Is your question purely for visualization or related to
fiber tracking based on ROIs transferred from another software programs (e.g.
functional results)?</span></font><o:p></o:p></p>

</div>

<div>

<p class=MsoNormal><font size=2 face=Arial><span style='font-size:10.0pt;
font-family:Arial'>If the former is the case, I must admit that DtiStudio has
only a limited capability in visualization. It can show superimpose of fiber
coordinates on 2D or triplane images, but I don't think it can show three
objects (2 images and 1 fiber objects) simultaneously.</span></font><o:p></o:p></p>

</div>

<div>

<p class=MsoNormal><font size=3 face="Times New Roman"><span style='font-size:
12.0pt'>&nbsp;<o:p></o:p></span></font></p>

</div>

<div>

<p class=MsoNormal><font size=2 face=Arial><span style='font-size:10.0pt;
font-family:Arial'>Susumu</span></font><o:p></o:p></p>

</div>

<blockquote style='border:none;border-left:solid black 1.5pt;padding:0in 0in 0in 4.0pt;
margin-left:3.75pt;margin-top:5.0pt;margin-right:0in;margin-bottom:5.0pt'>

<div>

<div>

<div style='font-size-adjust: none;font-stretch: normal'>

<p class=MsoNormal><font size=2 face=Arial><span style='font-size:10.0pt;
font-family:Arial'>----- Original Message ----- <o:p></o:p></span></font></p>

</div>

<div style='-moz-background-clip: -moz-initial;-moz-background-origin: -moz-initial;
-moz-background-inline-policy: -moz-initial;font-size-adjust: none;font-stretch: normal;
background-attachment:scroll;background-position-x:0%;background-position-y:
50%'>

<p class=MsoNormal style='background:#E4E4E4'><b><font size=2 face=Arial><span
style='font-size:10.0pt;font-family:Arial;font-weight:bold'>From:</span></font></b><font
size=2 face=Arial><span style='font-size:10.0pt;font-family:Arial'> <a
href="mailto:bjweiland@gmail.com" target="_blank" title="bjweiland@gmail.com">Barbara
Weiland</a> <o:p></o:p></span></font></p>

</div>

<div style='font-size-adjust: none;font-stretch: normal'>

<p class=MsoNormal><b><font size=2 face=Arial><span style='font-size:10.0pt;
font-family:Arial;font-weight:bold'>To:</span></font></b><font size=2
face=Arial><span style='font-size:10.0pt;font-family:Arial'> <a
href="mailto:Mristudio-users@mristudio.org" target="_blank"
title="Mristudio-users@mristudio.org">Mristudio-users@mristudio.org</a> <o:p></o:p></span></font></p>

</div>

<div style='font-size-adjust: none;font-stretch: normal'>

<p class=MsoNormal><b><font size=2 face=Arial><span style='font-size:10.0pt;
font-family:Arial;font-weight:bold'>Sent:</span></font></b><font size=2
face=Arial><span style='font-size:10.0pt;font-family:Arial'> Saturday, April
19, 2008 12:01 PM<o:p></o:p></span></font></p>

</div>

<div style='font-size-adjust: none;font-stretch: normal'>

<p class=MsoNormal><b><font size=2 face=Arial><span style='font-size:10.0pt;
font-family:Arial;font-weight:bold'>Subject:</span></font></b><font size=2
face=Arial><span style='font-size:10.0pt;font-family:Arial'> [Mristudio-users]
functional overlays<o:p></o:p></span></font></p>

</div>

<div>

<p class=MsoNormal><font size=3 face="Times New Roman"><span style='font-size:
12.0pt'><o:p>&nbsp;</o:p></span></font></p>

</div>

<p class=MsoNormal><font size=3 face="Times New Roman"><span style='font-size:
12.0pt'>Hi,&nbsp; This is not a specific DTIStudio question but here it
is:&nbsp; I want to overlay functional results (MEG) onto an anatomical scan
and then add fibers as well.&nbsp; I have found that I can add 2 functional
overlays in MRIcro but cannot see a way to combine the volumes and save
them.&nbsp; Even if I could save the anatomical with one overlay I could then
build the fibers on that in DTIStudio?&nbsp; I have also tried Mindseer which
has a command under the Advanced tab to combine volumes - but it never finishes
processing.&nbsp; Any hints or suggested software (preferrably PC based) would
be appreciated.<br>
<br>
Barbara<font color="#550055"><span style='color:#550055'> Weiland, PhD<br>
Post Doc Fellow/MEG Physicist<br>
Neuromagnetism Laboratory<br>
Neurology Research<br>
Henry Ford Health System<br>
2799 <st1:Street w:st="on"><st1:address w:st="on">W. Grand Blvd.</st1:address></st1:Street>,
CFP 79<br>
<st1:place w:st="on"><st1:City w:st="on">Detroit</st1:City>, <st1:State w:st="on">MI</st1:State>
 &nbsp;<st1:PostalCode w:st="on">48202-2689</st1:PostalCode></st1:place><br>
313-916-1075<br>
</span></font><a href="mailto:bjweiland@gmail.com" target="_blank">bjweiland@gmail.com</a><o:p></o:p></span></font></p>

</div>

</div>

<div class=MsoNormal align=center style='text-align:center'><font size=3
face="Times New Roman"><span style='font-size:12.0pt'>

<hr size=2 width="100%" align=center>

</span></font></div>

<p class=MsoNormal><font size=3 face="Times New Roman"><span style='font-size:
12.0pt'>_______________________________________________<br>
Mristudio-users mailing list<br>
<a href="mailto:Mristudio-users@mristudio.org" target="_blank">Mristudio-users@mristudio.org</a><br>
<a href="http://lists.mristudio.org/mailman/listinfo/mristudio-users"
target="_blank">http://lists.mristudio.org/mailman/listinfo/mristudio-users</a><o:p></o:p></span></font></p>

</blockquote>

</div>

<p class=MsoNormal style='margin-bottom:12.0pt'><font size=3
face="Times New Roman"><span style='font-size:12.0pt'><br>
_______________________________________________<br>
Mristudio-users mailing list<br>
<a href="mailto:Mristudio-users@mristudio.org">Mristudio-users@mristudio.org</a><br>
<a href="http://lists.mristudio.org/mailman/listinfo/mristudio-users"
target="_blank">http://lists.mristudio.org/mailman/listinfo/mristudio-users</a><o:p></o:p></span></font></p>

</div>

<p class=MsoNormal><font size=3 face="Times New Roman"><span style='font-size:
12.0pt'><o:p>&nbsp;</o:p></span></font></p>

</div>

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