<!DOCTYPE HTML PUBLIC "-//W3C//DTD HTML 4.0 Transitional//EN">
<HTML><HEAD><TITLE>DtiStudio and multiple acquisitions</TITLE>
<META http-equiv=Content-Type content="text/html; charset=iso-8859-1">
<META content="MSHTML 6.00.6000.16640" name=GENERATOR>
<STYLE></STYLE>
</HEAD>
<BODY bgColor=#ffffff>
<DIV><FONT face=Arial size=2>Hi Jeff,</FONT></DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2></FONT>&nbsp;</DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2>Let me try to answer your question in a generic 
way. As you know, we need at least 1 b0 and 6 DWIs for DTI. If you have these 7 
images, obtaining the tensor elements requires to "solve" the tensor 
equation.</FONT></DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2></FONT>&nbsp;</DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2>If you have more than 6 DWIs, then you have to 
do&nbsp;"fitting" to obtain the elements. This is very similar to the simple 
linear fitting. If you have two points, you solve the equation to get the slope. 
If you have 3 points, you do fitting for the best fit.</FONT></DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2></FONT>&nbsp;</DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2>When you have more than 6 DWIs, you have two 
choices; more orientations or more repetitions. In the analogy of the linear 
fitting, if you have 4 points, you can spread the 4 points along the x axis, or 
you can sample twice at two locations along the x axis. Statistically, there is 
not much difference between these two approaches. </FONT></DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2></FONT>&nbsp;</DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2>I guess my point is, the two datapoints at a fixed 
x value (or two DWIs with the same b-orientation) doesn't have to be averaged or 
need any special calculation. These are just dataponts to be fitted. For the 
tensor fitting, we can use the same math regardless of multiple points spread 
over different gradient orientations or repeated with the same orientation 
set.</FONT></DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2></FONT>&nbsp;</DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2>Hope this answers your question.</FONT></DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2></FONT>&nbsp;</DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2>Susumu</FONT></DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2></FONT>&nbsp;</DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2></FONT>&nbsp;</DIV>
<BLOCKQUOTE 
style="PADDING-RIGHT: 0px; PADDING-LEFT: 5px; MARGIN-LEFT: 5px; BORDER-LEFT: #000000 2px solid; MARGIN-RIGHT: 0px">
  <DIV style="FONT: 10pt arial">----- Original Message ----- </DIV>
  <DIV 
  style="BACKGROUND: #e4e4e4; FONT: 10pt arial; font-color: black"><B>From:</B> 
  <A title=rileyj@uci.edu href="mailto:rileyj@uci.edu">Riley, Jeffrey</A> </DIV>
  <DIV style="FONT: 10pt arial"><B>To:</B> <A 
  title=mristudio-users@mristudio.org 
  href="mailto:mristudio-users@mristudio.org">mristudio-users@mristudio.org</A> 
  </DIV>
  <DIV style="FONT: 10pt arial"><B>Sent:</B> Monday, April 21, 2008 6:27 
PM</DIV>
  <DIV style="FONT: 10pt arial"><B>Subject:</B> [Mristudio-users] DtiStudio and 
  multiple acquisitions</DIV>
  <DIV><BR></DIV><!-- Converted from text/plain format --><BR>
  <P><FONT size=2>Hi -<BR><BR>I have a question regarding multiple dti 
  acquisitions in DtiStudio; namely, how does the program incorporate both 
  acquisitions into the tensor calculations (i.e. are the two runs averaged, and 
  then the tensor calculation is done?) and at what part of the processing 
  pipeline does this occur?<BR><BR>Thanks for your help,<BR><BR>Jeff</FONT> </P>
  <P>
  <HR>

  <P></P>_______________________________________________<BR>Mristudio-users 
  mailing 
  list<BR>Mristudio-users@mristudio.org<BR>http://lists.mristudio.org/mailman/listinfo/mristudio-users<BR></BLOCKQUOTE></BODY></HTML>